RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492947.1

AGRN-209, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-209ENST00000492947 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.73■■□□□ 1.39
AGRN-209ENST00000492947 A0A1W2PP64 1363 aa23.72■■□□□ 1.39
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AGRN-209ENST00000492947 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
AGRN-209ENST00000492947 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
AGRN-209ENST00000492947 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.7■■□□□ 1.39
AGRN-209ENST00000492947 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
AGRN-209ENST00000492947 NME9Q86XW9 330 aa23.7■■□□□ 1.38
AGRN-209ENST00000492947 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.69■■□□□ 1.38
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AGRN-209ENST00000492947 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.69■■□□□ 1.38
AGRN-209ENST00000492947 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
AGRN-209ENST00000492947 ABCC6O95255 1503 aa23.69■■□□□ 1.38
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AGRN-209ENST00000492947 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.68■■□□□ 1.38
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AGRN-209ENST00000492947 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.67■■□□□ 1.38
AGRN-209ENST00000492947 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.67■■□□□ 1.38
AGRN-209ENST00000492947 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.66■■□□□ 1.38
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AGRN-209ENST00000492947 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
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AGRN-209ENST00000492947 USP47Q96K76 1375 aa23.65■■□□□ 1.38
AGRN-209ENST00000492947 PEAK1Q9H792 1746 aa23.65■■□□□ 1.38
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AGRN-209ENST00000492947 SOX12O15370 315 aa23.64■■□□□ 1.37
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AGRN-209ENST00000492947 PDE3BQ13370 1112 aa23.64■■□□□ 1.37
AGRN-209ENST00000492947 CDCA8Q53HL2 280 aa23.64■■□□□ 1.37
AGRN-209ENST00000492947 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.64■■□□□ 1.37
AGRN-209ENST00000492947 LRRC37A3O60309 1634 aa23.63■■□□□ 1.37
AGRN-209ENST00000492947 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.63■■□□□ 1.37
AGRN-209ENST00000492947 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.63■■□□□ 1.37
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AGRN-209ENST00000492947 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.58■■□□□ 1.37
AGRN-209ENST00000492947 BCL9O00512 1426 aa23.58■■□□□ 1.36
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AGRN-209ENST00000492947 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.56■■□□□ 1.36
AGRN-209ENST00000492947 LTN1O94822 1766 aa23.55■■□□□ 1.36
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AGRN-209ENST00000492947 APBA3O96018 575 aa23.55■■□□□ 1.36
AGRN-209ENST00000492947 DDB1Q16531 1140 aa23.55■■□□□ 1.36
AGRN-209ENST00000492947 RREB1Q92766 1687 aa23.54■■□□□ 1.36
AGRN-209ENST00000492947 CCDC7Q96M83 1385 aa23.53■■□□□ 1.36
AGRN-209ENST00000492947 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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AGRN-209ENST00000492947 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.51■■□□□ 1.35
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AGRN-209ENST00000492947 MYOM1P52179 1685 aa23.48■■□□□ 1.35
AGRN-209ENST00000492947 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.47■■□□□ 1.35
AGRN-209ENST00000492947 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.47■■□□□ 1.35
AGRN-209ENST00000492947 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.47■■□□□ 1.35
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AGRN-209ENST00000492947 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
AGRN-209ENST00000492947 EXOC5O00471 708 aa23.45■■□□□ 1.34
AGRN-209ENST00000492947 PLSCR1O15162 318 aa23.45■■□□□ 1.34
AGRN-209ENST00000492947 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.45■■□□□ 1.34
AGRN-209ENST00000492947 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
AGRN-209ENST00000492947 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.45■■□□□ 1.34
AGRN-209ENST00000492947 HOXC9P31274 260 aa23.43■■□□□ 1.34
AGRN-209ENST00000492947 PROM2Q8N271 834 aa23.43■■□□□ 1.34
AGRN-209ENST00000492947 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.42■■□□□ 1.34
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AGRN-209ENST00000492947 RTL1A6NKG5 1358 aa23.39■■□□□ 1.33
AGRN-209ENST00000492947 KCNQ2O43526 872 aa23.37■■□□□ 1.33
AGRN-209ENST00000492947 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
AGRN-209ENST00000492947 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.37■■□□□ 1.33
AGRN-209ENST00000492947 NHSQ6T4R5 1651 aa23.35■■□□□ 1.33
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AGRN-209ENST00000492947 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.34■■□□□ 1.33
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AGRN-209ENST00000492947 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.32■■□□□ 1.32
AGRN-209ENST00000492947 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.32■■□□□ 1.32
AGRN-209ENST00000492947 NBPF4Q96M43 638 aa23.32■■□□□ 1.32
AGRN-209ENST00000492947 NBPF14Q5TI25 921 aa23.31■■□□□ 1.32
AGRN-209ENST00000492947 MEGF6O75095 1541 aa23.31■■□□□ 1.32
AGRN-209ENST00000492947 INSRP06213 1382 aa23.3■■□□□ 1.32
AGRN-209ENST00000492947 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.3■■□□□ 1.32
AGRN-209ENST00000492947 TXNRD1Q16881 649 aa23.29■■□□□ 1.32
AGRN-209ENST00000492947 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.29■■□□□ 1.32
AGRN-209ENST00000492947 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.29■■□□□ 1.32
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