RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.53■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.53■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 MS4A1P11836 297 aa21.52■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.52■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.51■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.51■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 PEAK1Q9H792 1746 aa21.51■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.51■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.5■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.5■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 NLRP6P59044 892 aa21.49■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.49■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 PIK3C2AO00443 1686 aa21.49■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 PDE4AP27815 886 aa21.47■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.47■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 IGHDP01880 384 aa21.46■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 GNAI1P63096 354 aa21.46■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 IFT57Q9NWB7 429 aa21.46■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 MSH5O43196 834 aa21.46■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.46■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 SBNO1A3KN83 1393 aa21.46■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.45■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 FAM83GA6ND36 823 aa21.45■■□□□ 1.03
TOM1-216ENST00000492723 FLT4P35916 1363 aa21.45■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 AMPHP49418 695 aa21.45■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 AAMPQ13685 434 aa21.45■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 ABTB2Q8N961 1025 aa21.44■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 TRIM27P14373 513 aa21.43■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 BACH2Q9BYV9 841 aa21.43■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 ZNF853P0CG23 659 aa21.43■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 DCTN1Q14203 1278 aa21.43■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 C14orf37Q86TY3 774 aa21.43■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 MBIPQ9NS73 344 aa21.43■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.43■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.43■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.42■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.42■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 CFAP44Q96MT7 982 aa21.42■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 KIF16BQ96L93 1317 aa21.41■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.41■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 ARHGEF10O15013 1369 aa21.4■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 RGS3P49796 1198 aa21.4■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.4■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 ZNF428Q96B54 188 aa21.4■■□□□ 1.02
TOM1-216ENST00000492723 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 TSPYL6Q8N831 410 aa21.39■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 VAMP4O75379 141 aa21.39■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.38■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 PSME1Q06323 249 aa21.37■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 EYA1Q99502 592 aa21.36■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 HOXC9P31274 260 aa21.36■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 MCM10Q7L590 875 aa21.36■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.36■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.35■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.35■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 USP54Q70EL1 1684 aa21.34■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.34■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 KDRP35968 1356 aa21.34■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.34■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
TOM1-216ENST00000492723 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 FOXO3O43524 673 aa21.32■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 ORAI2Q96SN7 254 aa21.31■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 NWD1Q149M9 1564 aa21.31■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.3■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 FAM161AQ3B820 660 aa21.3■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.3■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 CHL1O00533 1208 aa21.29■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.28■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.27■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 RTL1A6NKG5 1358 aa21.27■■□□□ 1
TOM1-216ENST00000492723 C8orf34Q49A92 452 aa21.27■□□□□ 0.99
TOM1-216ENST00000492723 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.26■□□□□ 0.99
TOM1-216ENST00000492723 KRT24Q2M2I5 525 aa21.26■□□□□ 0.99
TOM1-216ENST00000492723 CRB1P82279 1406 aa21.26■□□□□ 0.99
TOM1-216ENST00000492723 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.25■□□□□ 0.99
TOM1-216ENST00000492723 LTN1O94822 1766 aa21.25■□□□□ 0.99
TOM1-216ENST00000492723 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.25■□□□□ 0.99
TOM1-216ENST00000492723 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.24■□□□□ 0.99
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