RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 HMOX1P09601 288 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 FLT4P35916 1363 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 TMEM94Q12767 1356 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 RIPK4P57078 832 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 STRCQ7RTU9 1775 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 SOX12O15370 315 aa24.72■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 ORAI2Q96SN7 254 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 IL16Q14005 1332 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 MS4A1P11836 297 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 NFE2L2Q16236 605 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-204ENST00000476231 CRBNQ96SW2 442 aa24.69■■□□□ 1.54
SYF2-204ENST00000476231 ATF3P18847 181 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-204ENST00000476231 AMPHP49418 695 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-204ENST00000476231 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-204ENST00000476231 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-204ENST00000476231 PLIN1O60240 522 aa24.67■■□□□ 1.54
SYF2-204ENST00000476231 MST1RQ04912 1400 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-204ENST00000476231 ARHGEF10O15013 1369 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-204ENST00000476231 FOXO3O43524 673 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-204ENST00000476231 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SYF2-204ENST00000476231 RTL1A6NKG5 1358 aa24.64■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 NFAT5O94916 1531 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 HOXC9P31274 260 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 MSH6P52701 1360 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 LTN1O94822 1766 aa24.6■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.6■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.6■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.6■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 BCAR3O75815 825 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 KDRP35968 1356 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 SLIT3O75094 1523 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.58■■□□□ 1.53
SYF2-204ENST00000476231 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 EYA1Q99502 592 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 ALS2Q96Q42 1657 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 IP6K1Q92551 441 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 USP19O94966 1318 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 IFT57Q9NWB7 429 aa24.53■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 GNAI1P63096 354 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 PDE3AQ14432 1141 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 BACH2Q9BYV9 841 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-204ENST00000476231 GCP02774 474 aa24.51■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 PDE4AP27815 886 aa24.51■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.51■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.5■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 ZNF853P0CG23 659 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 AAMPQ13685 434 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 CFAP44Q96MT7 982 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SYF2-204ENST00000476231 FAM83GA6ND36 823 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 ZNF428Q96B54 188 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 PXDNQ92626 1479 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 DCTN1Q14203 1278 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 MBIPQ9NS73 344 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 BRINP3Q76B58 766 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-204ENST00000476231 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 SLAIN2Q9P270 581 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms