RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM52Q96A61 297 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L5A8MUK1 530 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 SKOR1P84550 965 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 PIK3CDO00329 1044 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC19A1P41440 591 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 LIAT1Q6ZQX7 453 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 MPNDQ8N594 471 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 PLPP7Q8NBV4 271 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 VRTNQ9H8Y1 702 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A0G2JS52 829 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L3A6NCW0 530 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L4A6NCW7 530 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 ESPNB1AK53 854 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L2Q6R6M4 530 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L1Q7RTZ2 530 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 WNT7AO00755 349 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 ATG7O95352 703 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 EML3Q32P44 896 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 SIRT1Q96EB6 747 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 CDK15Q96Q40 435 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 NCOA4Q13772 614 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 SPRYD7Q5W111 196 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAF7Q6Q0C0 670 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM50Q86XT4 487 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 V9GY48 417 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-205ENST00000462042 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 NOD1Q9Y239 953 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 USTQ9Y2C2 406 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 RETREG2Q8NC44 543 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM196BA6NMK8 535 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP1A2P50993 1020 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 USP4Q13107 963 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 DEPDC4Q8N2C3 294 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 SIAH2O43255 324 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 ARID5BQ14865 1188 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 NR5A1Q13285 461 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 CDCA8Q53HL2 280 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF697Q5TEC3 545 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 OXLD1Q5BKU9 147 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 MRGPRX2Q96LB1 330 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-205ENST00000462042 ADH1CP00326 375 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 MYCP01106 439 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 RASA1P20936 1047 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 TSGA10IPQ3SY00 556 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 FSHRP23945 695 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 GRM5P41594 1212 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 LARGE2Q8N3Y3 721 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L15C9J2P7 530 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L10C9JJH3 530 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L12C9JPN9 530 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L11C9JVI0 530 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L21D6R901 530 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L18D6R9N7 530 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L22D6RA61 530 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L19D6RCP7 530 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L20D6RJB6 530 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB15P59190 212 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L24Q0WX57 530 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC116Q8IYX3 515 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 OGFOD1Q8N543 542 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 GTF2IP78347 998 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 PTK7Q13308 1070 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 RGS20O76081 388 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 ERVK-9P63128 1117 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXC1Q12948 553 aa10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms