RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 IFT57Q9NWB7 429 aa25.85■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 MBIPQ9NS73 344 aa25.84■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 CPS1P31327 1500 aa25.84■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.83■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.82■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 SIRT1Q96EB6 747 aa25.82■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 NUCB1Q02818 461 aa25.81■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.81■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 ZNF853P0CG23 659 aa25.81■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 LNPKQ9C0E8 428 aa25.81■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 TECPR2O15040 1411 aa25.8■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.8■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 TNRQ92752 1358 aa25.8■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 FAM83GA6ND36 823 aa25.8■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.8■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 CFAP44Q96MT7 982 aa25.78■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.77■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.77■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 DCTN1Q14203 1278 aa25.77■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
IMP4-208ENST00000460766 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.76■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.76■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.76■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.76■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 PTCH1Q13635 1447 aa25.76■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 NUTM2FA1L443 756 aa25.75■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 IL27Q8NEV9 243 aa25.75■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.74■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.74■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.74■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 PIK3R4Q99570 1358 aa25.73■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.73■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 ABCC4O15439 1325 aa25.72■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.72■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 C3P01024 1663 aa25.71■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.71■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 GCC1Q96CN9 775 aa25.71■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.71■■□□□ 1.71
IMP4-208ENST00000460766 ACEP12821 1306 aa25.7■■□□□ 1.7
IMP4-208ENST00000460766 ITSN1Q15811 1721 aa25.69■■□□□ 1.7
IMP4-208ENST00000460766 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
IMP4-208ENST00000460766 AKAP12Q02952 1782 aa25.68■■□□□ 1.7
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.68■■□□□ 1.7
IMP4-208ENST00000460766 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.67■■□□□ 1.7
IMP4-208ENST00000460766 SOX12O15370 315 aa25.66■■□□□ 1.7
IMP4-208ENST00000460766 LTKP29376 864 aa25.66■■□□□ 1.7
IMP4-208ENST00000460766 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.66■■□□□ 1.7
IMP4-208ENST00000460766 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.65■■□□□ 1.7
IMP4-208ENST00000460766 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.65■■□□□ 1.7
IMP4-208ENST00000460766 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.64■■□□□ 1.7
IMP4-208ENST00000460766 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.63■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.63■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 MCM10Q7L590 875 aa25.63■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.62■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 HSCBQ8IWL3 235 aa25.62■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 KRT24Q2M2I5 525 aa25.62■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.62■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.62■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.61■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.61■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 USP6P35125 1406 aa25.61■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.6■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
IMP4-208ENST00000460766 CHL1O00533 1208 aa25.58■■□□□ 1.68
IMP4-208ENST00000460766 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
IMP4-208ENST00000460766 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.56■■□□□ 1.68
IMP4-208ENST00000460766 EID1Q9Y6B2 187 aa25.56■■□□□ 1.68
IMP4-208ENST00000460766 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.55■■□□□ 1.68
IMP4-208ENST00000460766 PTPRUQ92729 1446 aa25.54■■□□□ 1.68
IMP4-208ENST00000460766 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
IMP4-208ENST00000460766 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.54■■□□□ 1.68
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.54■■□□□ 1.68
IMP4-208ENST00000460766 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.54■■□□□ 1.68
IMP4-208ENST00000460766 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.54■■□□□ 1.68
IMP4-208ENST00000460766 USP31Q70CQ4 1352 aa25.53■■□□□ 1.68
IMP4-208ENST00000460766 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.51■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 PEAK1Q9H792 1746 aa25.51■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 MCM4P33991 863 aa25.51■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 KIAA0232Q92628 1395 aa25.51■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.51■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 SNX21Q969T3 373 aa25.5■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 DCTPP1Q9H773 170 aa25.5■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 FOXO3O43524 673 aa25.49■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 RGS12O14924 1447 aa25.49■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 SSH2Q76I76 1423 aa25.49■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.48■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 PTPRCP08575 1304 aa25.48■■□□□ 1.67
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