RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.7■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 SLIT3O75094 1523 aa16.7■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.69■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.69■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.69■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 CABP2Q9NPB3 220 aa16.69■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 CABP1Q9NZU7 370 aa16.68■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 EVC2Q86UK5 1308 aa16.68■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.68■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 COL18A1P39060 1754 aa16.67■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 WNK3Q9BYP7 1800 aa16.67■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 BCL9O00512 1426 aa16.67■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 PROM2Q8N271 834 aa16.66■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16.65■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 MYOM1P52179 1685 aa16.65■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 AKAP12Q02952 1782 aa16.64■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.64■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 PIK3C2AO00443 1686 aa16.64■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.64■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.63■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 ZBTB7AO95365 584 aa16.63■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 CCDC7Q96M83 1385 aa16.63■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 ABCC6O95255 1503 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 PTGER2P43116 358 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 CARD10Q9BWT7 1032 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 STK32BQ9NY57 414 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 EXOC5O00471 708 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 ARHGEF25Q86VW2 580 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 RGPD5Q99666 1765 aa16.59■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 TXNRD1Q16881 649 aa16.59■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.59■□□□□ 0.25
PRAME-210ENST00000442481 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 TONSLQ96HA7 1378 aa16.57■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 TNS2Q63HR2 1409 aa16.56■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 SOX12O15370 315 aa16.56■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 SLC15A2Q16348 729 aa16.56■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.55■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 SYT17Q9BSW7 474 aa16.55■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 MTFR1LQ9H019 292 aa16.55■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 UTRNP46939 3433 aa16.54■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 NFAT5O94916 1531 aa16.54■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 NHSQ6T4R5 1651 aa16.53■□□□□ 0.24
PRAME-210ENST00000442481 PAPPAQ13219 1627 aa16.52■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.51■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 ERBB3P21860 1342 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 IL2RBP14784 551 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 ACSBG1Q96GR2 724 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 USP31Q70CQ4 1352 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 USP54Q70EL1 1684 aa16.49■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 ZNF827Q17R98 1081 aa16.47■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 ARXQ96QS3 562 aa16.47■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 MAP3K5Q99683 1374 aa16.47■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.46■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 CHD4Q14839 1912 aa16.46■□□□□ 0.23
PRAME-210ENST00000442481 LTN1O94822 1766 aa16.46■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 BTAF1O14981 1849 aa16.45■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 SLC16A10Q8TF71 515 aa16.45■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.44■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 POLD1P28340 1107 aa16.44■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 C1QTNF8P60827 252 aa16.44■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 SLC27A3Q5K4L6 730 aa16.44■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 TMC1Q8TDI8 760 aa16.44■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.44■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.44■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD24Q8TF21 1146 aa16.43■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 SLC24A1O60721 1099 aa16.41■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 NME9Q86XW9 330 aa16.41■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.41■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.41■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 AKT1S1Q96B36 256 aa16.4■□□□□ 0.22
PRAME-210ENST00000442481 QSER1Q2KHR3 1735 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 GPR162Q16538 588 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 COL24A1Q17RW2 1714 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 IP6K1Q92551 441 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 KLHL34Q8N239 644 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 KCNQ4P56696 695 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PP64 1363 aa16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms