RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ABTB2Q8N961 1025 aa22.2■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FOXO3O43524 673 aa22.19■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GSE1Q14687 1217 aa22.19■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.19■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.18■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.18■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.18■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NFKBIBQ15653 356 aa22.18■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SKAP1Q86WV1 359 aa22.18■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PEAK1Q9H792 1746 aa22.18■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF521Q96K83 1311 aa22.17■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM161AQ3B820 660 aa22.16■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.16■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.16■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.15■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NGEFQ8N5V2 710 aa22.15■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IL13P35225 146 aa22.15■■□□□ 1.14
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.13■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C8orf34Q49A92 452 aa22.13■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.13■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NEUROD2Q15784 382 aa22.11■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.11■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GOLGA2Q08379 1002 aa22.11■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SBNO1A3KN83 1393 aa22.1■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FCHSD2O94868 740 aa22.1■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.1■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.09■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FLT4P35916 1363 aa22.09■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.09■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WWC1Q8IX03 1113 aa22.08■■□□□ 1.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HMOX1P09601 288 aa22.08■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AMPHP49418 695 aa22.07■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LTN1O94822 1766 aa22.07■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRKAR2BP31323 418 aa22.06■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NFAT5O94916 1531 aa22.06■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.06■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ALS2Q96Q42 1657 aa22.06■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC4A3P48751 1232 aa22.05■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLFN5Q08AF3 891 aa22.05■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.05■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.04■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC27Q2M243 656 aa22.04■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.04■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.04■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLIT3O75094 1523 aa22.03■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.02■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HOXC9P31274 260 aa22.02■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BRINP3Q76B58 766 aa22.02■■□□□ 1.12
USP27X-AS1-201ENST00000437322 E9PSI1 815 aa22.01■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLAIN2Q9P270 581 aa22.01■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PXDNQ92626 1479 aa22.01■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RTL1A6NKG5 1358 aa22■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 USP19O94966 1318 aa22■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PLEKHG5O94827 1062 aa21.99■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.99■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.99■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.99■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WDR63Q8IWG1 891 aa21.99■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GCP02774 474 aa21.98■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RIPK4P57078 832 aa21.98■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.97■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARHGEF10O15013 1369 aa21.97■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.97■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NFE2L2Q16236 605 aa21.95■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IP6K1Q92551 441 aa21.95■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.95■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.94■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.94■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RGS3P49796 1198 aa21.94■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EYA1Q99502 592 aa21.94■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.93■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.93■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.93■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KDRP35968 1356 aa21.92■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.89■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PDE3AQ14432 1141 aa21.89■■□□□ 1.09
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms