RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.5■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 BECN1Q14457 450 aa21.47■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 RGS3P49796 1198 aa21.47■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 USP54Q70EL1 1684 aa21.46■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.46■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.46■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.45■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 USP19O94966 1318 aa21.45■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.44■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 FOXO3O43524 673 aa21.44■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 FSD2A1L4K1 749 aa21.43■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 USP31Q70CQ4 1352 aa21.41■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 SLAIN2Q9P270 581 aa21.41■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 PSME1Q06323 249 aa21.4■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 FBLN1P23142 703 aa21.4■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 BRINP3Q76B58 766 aa21.4■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.4■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 COG3Q96JB2 828 aa21.39■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 ALS2Q96Q42 1657 aa21.39■■□□□ 1.02
CNGA3-205ENST00000436404 SHPRHQ149N8 1683 aa21.39■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 MTHFSP49914 203 aa21.38■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 PXDNQ92626 1479 aa21.38■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.37■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.36■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.35■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.35■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 ABTB2Q8N961 1025 aa21.34■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 POLKQ9UBT6 870 aa21.34■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.34■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 PANK2Q9BZ23 570 aa21.34■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.33■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 PEAK1Q9H792 1746 aa21.33■■□□□ 1.01
CNGA3-205ENST00000436404 NLRP6P59044 892 aa21.32■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 ARXQ96QS3 562 aa21.32■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.32■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.32■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 SEC24BO95487 1268 aa21.31■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.31■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 SBNO1A3KN83 1393 aa21.3■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 MRE11P49959 708 aa21.3■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 SLIT3O75094 1523 aa21.29■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 NFAT5O94916 1531 aa21.29■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.29■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 MCM4P33991 863 aa21.28■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.28■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
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CNGA3-205ENST00000436404 ESPNB1AK53 854 aa21.27■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 LTN1O94822 1766 aa21.27■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CNGA3-205ENST00000436404 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.26■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 SOX12O15370 315 aa21.26■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 TPM2P07951 284 aa21.26■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 GOLGA2Q08379 1002 aa21.26■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.25■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.25■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 CFAP53Q96M91 514 aa21.25■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.25■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF521Q96K83 1311 aa21.25■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.24■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.24■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 IGHDP01880 384 aa21.24■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.24■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.23■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.22■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
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CNGA3-205ENST00000436404 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.22■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 TRAK2O60296 914 aa21.21■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.21■□□□□ 0.99
CNGA3-205ENST00000436404 SLFN5Q08AF3 891 aa21.2■□□□□ 0.98
CNGA3-205ENST00000436404 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.2■□□□□ 0.98
CNGA3-205ENST00000436404 ERBB4Q15303 1308 aa21.19■□□□□ 0.98
CNGA3-205ENST00000436404 ABCA3Q99758 1704 aa21.19■□□□□ 0.98
CNGA3-205ENST00000436404 GCP02774 474 aa21.19■□□□□ 0.98
CNGA3-205ENST00000436404 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGEF10O15013 1369 aa21.18■□□□□ 0.98
CNGA3-205ENST00000436404 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.18■□□□□ 0.98
CNGA3-205ENST00000436404 FLT4P35916 1363 aa21.17■□□□□ 0.98
CNGA3-205ENST00000436404 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.17■□□□□ 0.98
CNGA3-205ENST00000436404 IL13P35225 146 aa21.17■□□□□ 0.98
CNGA3-205ENST00000436404 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.17■□□□□ 0.98
CNGA3-205ENST00000436404 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
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