RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	25.17	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		25.16	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		25.16	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	YY1	P25490	414 aa		25.16	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	DDB1	Q16531	1140 aa		25.16	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		25.16	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	COL18A1	P39060	1754 aa		25.15	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		25.15	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		25.14	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		25.14	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	PEAK1	Q9H792	1746 aa		25.13	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	25.13	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	25.13	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		25.11	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	25.11	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		25.11	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SBF2	Q86WG5	1849 aa		25.11	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	USP54	Q70EL1	1684 aa		25.1	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	25.1	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		25.09	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TESK2	Q96S53	571 aa		25.09	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		25.09	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		25.08	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	25.08	■■□□□ 1.61
MRPL28-203	ENST00000429738	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	25.08	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		25.08	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	NFAT5	O94916	1531 aa		25.07	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		25.07	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		25.07	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	25.07	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC37A3	O60309	1634 aa		25.07	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	USP31	Q70CQ4	1352 aa		25.06	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		25.06	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	PROM2	Q8N271	834 aa		25.06	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	BCL9	O00512	1426 aa		25.05	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		25.05	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	RGPD5	Q99666	1765 aa		25.05	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		25.04	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	TMC1	Q8TDI8	760 aa		25.03	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PP64	1363 aa		25.02	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	25.02	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCC6	O95255	1503 aa		25.02	■■□□□ 1.6
MRPL28-203	ENST00000429738	EXOC5	O00471	708 aa		25.01	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC24A1	O60721	1099 aa		25.01	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		25.01	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	25.01	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	25.01	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	25.01	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		25	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		25	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	SOX12	O15370	315 aa		24.99	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		24.99	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	CASZ1	Q86V15	1759 aa		24.98	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB7A	O95365	584 aa		24.98	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	TXNRD1	Q16881	649 aa		24.98	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	NME9	Q86XW9	330 aa		24.98	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	USP47	Q96K76	1375 aa		24.97	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		24.97	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	STK32B	Q9NY57	414 aa		24.96	■■□□□ 1.59
MRPL28-203	ENST00000429738	PTGER2	P43116	358 aa		24.95	■■□□□ 1.58
MRPL28-203	ENST00000429738	LTN1	O94822	1766 aa		24.95	■■□□□ 1.58
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC7	Q96M83	1385 aa		24.94	■■□□□ 1.58
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC15A2	Q16348	729 aa		24.94	■■□□□ 1.58
MRPL28-203	ENST00000429738	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	24.94	■■□□□ 1.58
MRPL28-203	ENST00000429738	TMF1	P82094	1093 aa		24.89	■■□□□ 1.58
MRPL28-203	ENST00000429738	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		24.89	■■□□□ 1.58
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		24.89	■■□□□ 1.57
MRPL28-203	ENST00000429738	MTFR1L	Q9H019	292 aa		24.88	■■□□□ 1.57
MRPL28-203	ENST00000429738	ERBB3	P21860	1342 aa		24.87	■■□□□ 1.57
MRPL28-203	ENST00000429738	SYT17	Q9BSW7	474 aa		24.87	■■□□□ 1.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TNS2	Q63HR2	1409 aa		24.86	■■□□□ 1.57
MRPL28-203	ENST00000429738	MYOM1	P52179	1685 aa		24.86	■■□□□ 1.57
MRPL28-203	ENST00000429738	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		24.85	■■□□□ 1.57
MRPL28-203	ENST00000429738	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	24.85	■■□□□ 1.57
MRPL28-203	ENST00000429738	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		24.85	■■□□□ 1.57
MRPL28-203	ENST00000429738	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		24.84	■■□□□ 1.57
MRPL28-203	ENST00000429738	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		24.84	■■□□□ 1.57
MRPL28-203	ENST00000429738	IL2RB	P14784	551 aa		24.82	■■□□□ 1.56
MRPL28-203	ENST00000429738	UTRN	P46939	3433 aa		24.82	■■□□□ 1.56
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	24.81	■■□□□ 1.56
MRPL28-203	ENST00000429738	NHS	Q6T4R5	1651 aa		24.81	■■□□□ 1.56
MRPL28-203	ENST00000429738	CDCA8	Q53HL2	280 aa		24.8	■■□□□ 1.56
MRPL28-203	ENST00000429738	COG3	Q96JB2	828 aa		24.79	■■□□□ 1.56
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		24.78	■■□□□ 1.56
MRPL28-203	ENST00000429738	IP6K1	Q92551	441 aa		24.78	■■□□□ 1.56
MRPL28-203	ENST00000429738	ARX	Q96QS3	562 aa		24.78	■■□□□ 1.56
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	24.78	■■□□□ 1.56
MRPL28-203	ENST00000429738	FYB1	O15117	783 aa		24.75	■■□□□ 1.55
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		24.75	■■□□□ 1.55
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		24.75	■■□□□ 1.55
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		24.74	■■□□□ 1.55
MRPL28-203	ENST00000429738	CHD4	Q14839	1912 aa		24.73	■■□□□ 1.55
MRPL28-203	ENST00000429738	BTAF1	O14981	1849 aa		24.73	■■□□□ 1.55
MRPL28-203	ENST00000429738	FBLN1	P23142	703 aa		24.73	■■□□□ 1.55
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF827	Q17R98	1081 aa		24.73	■■□□□ 1.55
MRPL28-203	ENST00000429738	PAPPA	Q13219	1627 aa		24.72	■■□□□ 1.55
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP3K5	Q99683	1374 aa		24.72	■■□□□ 1.55
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXC9	P31274	260 aa		24.71	■■□□□ 1.55
MRPL28-203	ENST00000429738	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		24.71	■■□□□ 1.55
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		24.7	■■□□□ 1.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms