RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375011.3

GALNT12-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT12, Length 2,735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT12-201ENST00000375011 VAMP4O75379 141 aa29.3■■■□□ 2.28
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GALNT12-201ENST00000375011 MBIPQ9NS73 344 aa29.3■■■□□ 2.28
GALNT12-201ENST00000375011 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.3■■■□□ 2.28
GALNT12-201ENST00000375011 SOX12O15370 315 aa29.29■■■□□ 2.28
GALNT12-201ENST00000375011 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.29■■■□□ 2.28
GALNT12-201ENST00000375011 LNPKQ9C0E8 428 aa29.29■■■□□ 2.28
GALNT12-201ENST00000375011 GSE1Q14687 1217 aa29.29■■■□□ 2.28
GALNT12-201ENST00000375011 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.29■■■□□ 2.28
GALNT12-201ENST00000375011 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
GALNT12-201ENST00000375011 BECN1Q14457 450 aa29.27■■■□□ 2.28
GALNT12-201ENST00000375011 SMC5Q8IY18 1101 aa29.27■■■□□ 2.28
GALNT12-201ENST00000375011 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.26■■■□□ 2.27
GALNT12-201ENST00000375011 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.26■■■□□ 2.27
GALNT12-201ENST00000375011 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
GALNT12-201ENST00000375011 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.25■■■□□ 2.27
GALNT12-201ENST00000375011 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.24■■■□□ 2.27
GALNT12-201ENST00000375011 GNAI1P63096 354 aa29.23■■■□□ 2.27
GALNT12-201ENST00000375011 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.22■■■□□ 2.27
GALNT12-201ENST00000375011 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
GALNT12-201ENST00000375011 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
GALNT12-201ENST00000375011 IFT57Q9NWB7 429 aa29.21■■■□□ 2.27
GALNT12-201ENST00000375011 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
GALNT12-201ENST00000375011 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.21■■■□□ 2.27
GALNT12-201ENST00000375011 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
GALNT12-201ENST00000375011 TNRQ92752 1358 aa29.2■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 KRT24Q2M2I5 525 aa29.2■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 C22orf23Q9BZE7 217 aa29.19■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF853P0CG23 659 aa29.19■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 LTKP29376 864 aa29.19■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.18■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 NUCB1Q02818 461 aa29.18■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.17■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.17■■■□□ 2.26
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GALNT12-201ENST00000375011 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
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GALNT12-201ENST00000375011 ACEP12821 1306 aa29.16■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.16■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 CHD1LQ86WJ1 897 aa29.16■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.15■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.14■■■□□ 2.26
GALNT12-201ENST00000375011 MCM10Q7L590 875 aa29.14■■■□□ 2.25
GALNT12-201ENST00000375011 ANTXR1Q9H6X2 564 aa29.14■■■□□ 2.25
GALNT12-201ENST00000375011 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.14■■■□□ 2.25
GALNT12-201ENST00000375011 SIRT2Q8IXJ6 389 aa29.13■■■□□ 2.25
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
GALNT12-201ENST00000375011 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.13■■■□□ 2.25
GALNT12-201ENST00000375011 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF428Q96B54 188 aa29.12■■■□□ 2.25
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GALNT12-201ENST00000375011 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.12■■■□□ 2.25
GALNT12-201ENST00000375011 C3P01024 1663 aa29.11■■■□□ 2.25
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GALNT12-201ENST00000375011 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
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GALNT12-201ENST00000375011 ARHGAP45Q92619 1136 aa29.08■■■□□ 2.25
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GALNT12-201ENST00000375011 PTCH1Q13635 1447 aa29.08■■■□□ 2.25
GALNT12-201ENST00000375011 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.07■■■□□ 2.24
GALNT12-201ENST00000375011 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.07■■■□□ 2.24
GALNT12-201ENST00000375011 ABCC4O15439 1325 aa29.07■■■□□ 2.24
GALNT12-201ENST00000375011 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.07■■■□□ 2.24
GALNT12-201ENST00000375011 FOXO3O43524 673 aa29.03■■■□□ 2.24
GALNT12-201ENST00000375011 PIK3R4Q99570 1358 aa29.02■■■□□ 2.24
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GALNT12-201ENST00000375011 GCC1Q96CN9 775 aa29■■■□□ 2.23
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GALNT12-201ENST00000375011 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.99■■■□□ 2.23
GALNT12-201ENST00000375011 USP6P35125 1406 aa28.98■■■□□ 2.23
GALNT12-201ENST00000375011 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.97■■■□□ 2.23
GALNT12-201ENST00000375011 PEAK1Q9H792 1746 aa28.97■■■□□ 2.23
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GALNT12-201ENST00000375011 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.97■■■□□ 2.23
GALNT12-201ENST00000375011 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.96■■■□□ 2.23
GALNT12-201ENST00000375011 APBB1O00213 710 aa28.96■■■□□ 2.23
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GALNT12-201ENST00000375011 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.95■■■□□ 2.22
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GALNT12-201ENST00000375011 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.93■■■□□ 2.22
GALNT12-201ENST00000375011 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa28.93■■■□□ 2.22
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GALNT12-201ENST00000375011 HSCBQ8IWL3 235 aa28.93■■■□□ 2.22
GALNT12-201ENST00000375011 EID1Q9Y6B2 187 aa28.92■■■□□ 2.22
GALNT12-201ENST00000375011 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
GALNT12-201ENST00000375011 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
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GALNT12-201ENST00000375011 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
GALNT12-201ENST00000375011 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
GALNT12-201ENST00000375011 SLC4A2P04920 1241 aa28.89■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.88■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 FOXD4L1Q9NU39 408 aa28.88■■■□□ 2.21
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