RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 POTEAQ6S8J7 498 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 KIF6Q6ZMV9 814 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 TESK2Q96S53 571 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3C2GO75747 1445 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 NEXNQ0ZGT2 675 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 IFNL2Q8IZJ0 200 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 BEGAINQ9BUH8 593 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 MADDQ8WXG6 1647 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3C2BO00750 1634 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 GNPATO15228 680 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC146Q8IYE0 955 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 GAS2L2Q8NHY3 880 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 MROH2AA6NES4 1674 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 VPS37DQ86XT2 251 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 TSPYL4Q9UJ04 414 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 METP08581 1390 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 ZFYVE9O95405 1425 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 FAM83GA6ND36 823 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 FCHSD2O94868 740 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 TRAPPC3LQ5T215 181 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 RIC3Q7Z5B4 369 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 MYL6BP14649 208 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 KCNQ4P56696 695 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0232Q92628 1395 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 PLIN1O60240 522 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC125Q86Z20 511 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 NEURL4Q96JN8 1562 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 C3P01024 1663 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 DDX58O95786 925 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 YY1P25490 414 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 TTC21AQ8NDW8 1320 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 PRKAR2BP31323 418 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 AMOTQ4VCS5 1084 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 RIPK4P57078 832 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 ILDR2Q71H61 639 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 NRXN1Q9ULB1 1477 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 MYO5BQ9ULV0 1848 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 PPLO60437 1756 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 BTBD11A6QL63 1104 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 JDP2Q8WYK2 163 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF6Q5VWK0 638 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF4Q96M43 638 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 ALKQ9UM73 1620 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 ABCC11Q96J66 1382 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf229H3BNL8 230 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 CCER2I3L3R5 266 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 TAOK2Q9UL54 1235 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3R4Q99570 1358 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 APBB1O00213 710 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 RALBP1Q15311 655 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 DPY19L2Q6NUT2 758 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 SETDB2Q96T68 719 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC87Q9NVE4 849 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 GPTP24298 496 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 ROBO2Q9HCK4 1378 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM34Q9BYJ4 488 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 GJA3Q9Y6H8 435 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 ST5P78524 1137 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 SLC39A6Q13433 755 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 VPS72Q15906 364 aa5.64□□□□□ -1.51
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