RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC57Q2TAC2 916 aa19.61■□□□□ 0.73
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SH3BP4-201ENST00000344528 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
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SH3BP4-201ENST00000344528 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
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SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF652Q9Y2D9 606 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4-201ENST00000344528 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
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SH3BP4-201ENST00000344528 TNRQ92752 1358 aa19.46■□□□□ 0.71
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SH3BP4-201ENST00000344528 PRM3Q9NNZ6 103 aa19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP10BO94823 1461 aa19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT32Q14532 448 aa19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 STK38Q15208 465 aa19.44■□□□□ 0.7
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SH3BP4-201ENST00000344528 RAB11FIP3O75154 756 aa19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 USHBP1Q8N6Y0 703 aa19.42■□□□□ 0.7
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