RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 TSPYL6Q8N831 410 aa26.95■■□□□ 1.91
PTDSS1-201ENST00000337004 MBIPQ9NS73 344 aa26.95■■□□□ 1.91
PTDSS1-201ENST00000337004 PTCH1Q13635 1447 aa26.95■■□□□ 1.91
PTDSS1-201ENST00000337004 MCM4P33991 863 aa26.95■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.94■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 AGLP35573 1532 aa26.94■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 COG3Q96JB2 828 aa26.94■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 CFAP44Q96MT7 982 aa26.93■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.92■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.91■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 REREQ9P2R6 1566 aa26.91■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 SNX21Q969T3 373 aa26.91■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 ABCC4O15439 1325 aa26.91■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.91■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.89■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.89■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.89■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 SIRT1Q96EB6 747 aa26.87■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 METP08581 1390 aa26.87■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.87■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.87■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.87■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.86■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 MLECQ14165 292 aa26.85■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.84■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.84■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.82■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.82■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM83GA6ND36 823 aa26.81■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa26.81■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.81■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 TRAK2O60296 914 aa26.81■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.81■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 DDIT3P35638 169 aa26.8■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.79■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 CPS1P31327 1500 aa26.79■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 DCTN1Q14203 1278 aa26.78■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 TECPR2O15040 1411 aa26.77■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.76■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 FSD2A1L4K1 749 aa26.76■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 KIF2CQ99661 725 aa26.76■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 DIP2BQ9P265 1576 aa26.75■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 CDC45O75419 566 aa26.75■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 DCTPP1Q9H773 170 aa26.74■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.73■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.71■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.71■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 GBP4Q96PP9 640 aa26.71■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 CHL1O00533 1208 aa26.7■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.7■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.7■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.69■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.69■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 C3P01024 1663 aa26.68■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.68■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 ARXQ96QS3 562 aa26.68■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.67■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 KIAA0232Q92628 1395 aa26.67■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 PTMSP20962 102 aa26.66■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 PTPRCP08575 1304 aa26.66■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 MRE11P49959 708 aa26.65■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.65■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 TTC22Q5TAA0 569 aa26.65■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 MCM10Q7L590 875 aa26.64■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 TSPOAP1O95153 1857 aa26.64■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 ACEP12821 1306 aa26.64■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.64■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 AKAP12Q02952 1782 aa26.63■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.63■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.63■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 KRT24Q2M2I5 525 aa26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms