RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 NBPF14Q5TI25 921 aa30.06■■■□□ 2.4
SOCS1-201ENST00000332029 NUP188Q5SRE5 1749 aa30.05■■■□□ 2.4
SOCS1-201ENST00000332029 LRRC37A3O60309 1634 aa30.05■■■□□ 2.4
SOCS1-201ENST00000332029 SOX12O15370 315 aa30.05■■■□□ 2.4
SOCS1-201ENST00000332029 AKAP12Q02952 1782 aa30.05■■■□□ 2.4
SOCS1-201ENST00000332029 PEAK1Q9H792 1746 aa30.04■■■□□ 2.4
SOCS1-201ENST00000332029 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SOCS1-201ENST00000332029 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa30.01■■■□□ 2.39
SOCS1-201ENST00000332029 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa30■■■□□ 2.39
SOCS1-201ENST00000332029 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
SOCS1-201ENST00000332029 TONSLQ96HA7 1378 aa30■■■□□ 2.39
SOCS1-201ENST00000332029 NFAT5O94916 1531 aa29.99■■■□□ 2.39
SOCS1-201ENST00000332029 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.98■■■□□ 2.39
SOCS1-201ENST00000332029 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.98■■■□□ 2.39
SOCS1-201ENST00000332029 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
SOCS1-201ENST00000332029 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.96■■■□□ 2.39
SOCS1-201ENST00000332029 PLSCR1O15162 318 aa29.95■■■□□ 2.39
SOCS1-201ENST00000332029 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
SOCS1-201ENST00000332029 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.93■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 ABCC6O95255 1503 aa29.93■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.93■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 BCL9O00512 1426 aa29.93■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 USP31Q70CQ4 1352 aa29.92■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.92■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC7Q96M83 1385 aa29.91■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 RGPD5Q99666 1765 aa29.91■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.91■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 SBF2Q86WG5 1849 aa29.91■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 TMC1Q8TDI8 760 aa29.9■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 NME9Q86XW9 330 aa29.89■■■□□ 2.38
SOCS1-201ENST00000332029 EXOC5O00471 708 aa29.88■■■□□ 2.37
SOCS1-201ENST00000332029 SPON1Q9HCB6 807 aa29.88■■■□□ 2.37
SOCS1-201ENST00000332029 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
SOCS1-201ENST00000332029 KCNQ2O43526 872 aa29.86■■■□□ 2.37
SOCS1-201ENST00000332029 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
SOCS1-201ENST00000332029 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.85■■■□□ 2.37
SOCS1-201ENST00000332029 USP54Q70EL1 1684 aa29.85■■■□□ 2.37
SOCS1-201ENST00000332029 ERBB3P21860 1342 aa29.84■■■□□ 2.37
SOCS1-201ENST00000332029 TNS2Q63HR2 1409 aa29.84■■■□□ 2.37
SOCS1-201ENST00000332029 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
SOCS1-201ENST00000332029 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
SOCS1-201ENST00000332029 PROM2Q8N271 834 aa29.82■■■□□ 2.36
SOCS1-201ENST00000332029 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.81■■■□□ 2.36
SOCS1-201ENST00000332029 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.81■■■□□ 2.36
SOCS1-201ENST00000332029 A0A1W2PP64 1363 aa29.8■■■□□ 2.36
SOCS1-201ENST00000332029 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SOCS1-201ENST00000332029 TXNRD1Q16881 649 aa29.77■■■□□ 2.36
SOCS1-201ENST00000332029 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.77■■■□□ 2.36
SOCS1-201ENST00000332029 IL2RBP14784 551 aa29.76■■■□□ 2.35
SOCS1-201ENST00000332029 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.75■■■□□ 2.35
SOCS1-201ENST00000332029 LTN1O94822 1766 aa29.75■■■□□ 2.35
SOCS1-201ENST00000332029 CASZ1Q86V15 1759 aa29.73■■■□□ 2.35
SOCS1-201ENST00000332029 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
SOCS1-201ENST00000332029 STK32BQ9NY57 414 aa29.73■■■□□ 2.35
SOCS1-201ENST00000332029 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.72■■■□□ 2.35
SOCS1-201ENST00000332029 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.71■■■□□ 2.35
SOCS1-201ENST00000332029 TESK2Q96S53 571 aa29.71■■■□□ 2.35
SOCS1-201ENST00000332029 NHSQ6T4R5 1651 aa29.7■■■□□ 2.35
SOCS1-201ENST00000332029 ZBTB7AO95365 584 aa29.69■■■□□ 2.34
SOCS1-201ENST00000332029 SLC15A2Q16348 729 aa29.68■■■□□ 2.34
SOCS1-201ENST00000332029 SLC24A1O60721 1099 aa29.67■■■□□ 2.34
SOCS1-201ENST00000332029 IP6K1Q92551 441 aa29.67■■■□□ 2.34
SOCS1-201ENST00000332029 DCAF8L1A6NGE4 600 aa29.64■■■□□ 2.34
SOCS1-201ENST00000332029 COG3Q96JB2 828 aa29.64■■■□□ 2.34
SOCS1-201ENST00000332029 YY1P25490 414 aa29.63■■■□□ 2.33
SOCS1-201ENST00000332029 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
SOCS1-201ENST00000332029 PTGER2P43116 358 aa29.62■■■□□ 2.33
SOCS1-201ENST00000332029 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
SOCS1-201ENST00000332029 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.6■■■□□ 2.33
SOCS1-201ENST00000332029 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.58■■■□□ 2.33
SOCS1-201ENST00000332029 MYOM1P52179 1685 aa29.57■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 USP47Q96K76 1375 aa29.57■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 HOXC9P31274 260 aa29.57■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 AMPHP49418 695 aa29.57■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 MTFR1LQ9H019 292 aa29.57■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 BTAF1O14981 1849 aa29.57■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 FBLN1P23142 703 aa29.56■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 PAPPAQ13219 1627 aa29.56■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 TMF1P82094 1093 aa29.54■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.54■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.53■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 LRRC4BQ9NT99 713 aa29.52■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.51■■■□□ 2.32
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF827Q17R98 1081 aa29.51■■■□□ 2.31
SOCS1-201ENST00000332029 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.51■■■□□ 2.31
SOCS1-201ENST00000332029 RTL1A6NKG5 1358 aa29.51■■■□□ 2.31
SOCS1-201ENST00000332029 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
SOCS1-201ENST00000332029 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
SOCS1-201ENST00000332029 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.48■■■□□ 2.31
SOCS1-201ENST00000332029 FYB1O15117 783 aa29.47■■■□□ 2.31
SOCS1-201ENST00000332029 SLC27A3Q5K4L6 730 aa29.47■■■□□ 2.31
SOCS1-201ENST00000332029 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
SOCS1-201ENST00000332029 SYT17Q9BSW7 474 aa29.47■■■□□ 2.31
SOCS1-201ENST00000332029 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.46■■■□□ 2.31
SOCS1-201ENST00000332029 MEGF6O75095 1541 aa29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms