RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 USP54Q70EL1 1684 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 HSPA2P54652 639 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 SBNO1A3KN83 1393 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 ORAI2Q96SN7 254 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 PSME1Q06323 249 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 AMPHP49418 695 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 FLT4P35916 1363 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.14■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
ACTB-201ENST00000331789 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 FOXO3O43524 673 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 PDE3AQ14432 1141 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 HOXC9P31274 260 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 PANK1Q8TE04 598 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF10O15013 1369 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 FAM83GA6ND36 823 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 TNNQ9UQP3 1299 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 TMEM94Q12767 1356 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 LTN1O94822 1766 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 EYA1Q99502 592 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-201ENST00000331789 DCTN1Q14203 1278 aa23.08■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 COG6Q9Y2V7 657 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 ZNF853P0CG23 659 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 GNAI1P63096 354 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 IFT57Q9NWB7 429 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 NFAT5O94916 1531 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 RLBP1P12271 317 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 ATF3P18847 181 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 MBIPQ9NS73 344 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 KIF1AQ12756 1690 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 STRCQ7RTU9 1775 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 KDRP35968 1356 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHG5O94827 1062 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 CFAP44Q96MT7 982 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-201ENST00000331789 MST1RQ04912 1400 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 RTL1A6NKG5 1358 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 KCNH5Q8NCM2 988 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 MCM10Q7L590 875 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 IP6K1Q92551 441 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 TSPYL6Q8N831 410 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 VAMP4O75379 141 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 DCCP43146 1447 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 GCP02774 474 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 SLIT3O75094 1523 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 SKAP1Q86WV1 359 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTB-201ENST00000331789 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 TRIM27P14373 513 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 USP19O94966 1318 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 ALS2Q96Q42 1657 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 CHL1O00533 1208 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 ZNF428Q96B54 188 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 MS4A1P11836 297 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms