RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269143.7

AFG3L2-201, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AFG3L2, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-201ENST00000269143 CFAP53Q96M91 514 aa20.24■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 STK26Q9P289 416 aa20.24■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.24■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.23■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.23■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 OSCARQ8IYS5 282 aa20.23■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.23■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.23■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 KIF1BO60333 1816 aa20.23■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.22■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 MCM5P33992 734 aa20.21■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.21■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 ATP2B3Q16720 1220 aa20.21■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 GGT6Q6P531 493 aa20.21■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.21■□□□□ 0.83
AFG3L2-201ENST00000269143 ERVK-7P63135 1459 aa20.2■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 CCDC27Q2M243 656 aa20.2■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.2■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 ASXL2Q76L83 1435 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 KANK1Q14678 1352 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 FBLN1P23142 703 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 CDC45O75419 566 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 CABP2Q9NPB3 220 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 RABEP1Q15276 862 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 APBB1O00213 710 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 PLCB2Q00722 1185 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 ADGRB3O60242 1522 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.15■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
AFG3L2-201ENST00000269143 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 TSPY26PQ9H489 355 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 USP25Q9UHP3 1055 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 KIF3AQ9Y496 699 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 PPLO60437 1756 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 GCC1Q96CN9 775 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 SHPRHQ149N8 1683 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 PDE4CQ08493 712 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 ST18O60284 1047 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 USP26Q9BXU7 913 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.08■□□□□ 0.81
AFG3L2-201ENST00000269143 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 ADGRB1O14514 1584 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 ZBTB22O15209 634 aa20.06■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.06■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 KIF20AO95235 890 aa20.06■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 NPATQ14207 1427 aa20.05■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 VGLL3A8MV65 326 aa20.05■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.05■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 MBD3O95983 291 aa20.05■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.05■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 NOS1P29475 1434 aa20.05■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.05■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.04■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.04■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 CD109Q6YHK3 1445 aa20.04■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 ADCY5O95622 1261 aa20.04■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.04■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.03■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 NEK4P51957 841 aa20.03■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
AFG3L2-201ENST00000269143 SLC24A1O60721 1099 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms