RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.76■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.76■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 HMOX1P09601 288 aa25.76■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.76■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.75■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 IL13P35225 146 aa25.74■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 PDE3AQ14432 1141 aa25.73■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.73■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.73■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.73■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 IGHDP01880 384 aa25.73■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.73■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.72■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 PRKAR2BP31323 418 aa25.71■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 FCHSD2O94868 740 aa25.7■■□□□ 1.71
VGF-201ENST00000249330 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
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VGF-201ENST00000249330 NLRP6P59044 892 aa25.7■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 CCDC27Q2M243 656 aa25.69■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.69■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 USP19O94966 1318 aa25.69■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 ORAI2Q96SN7 254 aa25.69■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 BECN1Q14457 450 aa25.68■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.68■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.68■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 USP31Q70CQ4 1352 aa25.67■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 ABTB2Q8N961 1025 aa25.67■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.67■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 RIPK4P57078 832 aa25.67■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 WDR63Q8IWG1 891 aa25.67■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.65■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.65■■□□□ 1.7
VGF-201ENST00000249330 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
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VGF-201ENST00000249330 COG6Q9Y2V7 657 aa25.64■■□□□ 1.69
VGF-201ENST00000249330 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
VGF-201ENST00000249330 PSME1Q06323 249 aa25.63■■□□□ 1.69
VGF-201ENST00000249330 PANK1Q8TE04 598 aa25.63■■□□□ 1.69
VGF-201ENST00000249330 NWD1Q149M9 1564 aa25.63■■□□□ 1.69
VGF-201ENST00000249330 FOXO3O43524 673 aa25.63■■□□□ 1.69
VGF-201ENST00000249330 SEC24BO95487 1268 aa25.6■■□□□ 1.69
VGF-201ENST00000249330 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.6■■□□□ 1.69
VGF-201ENST00000249330 PEAK1Q9H792 1746 aa25.6■■□□□ 1.69
VGF-201ENST00000249330 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
VGF-201ENST00000249330 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.6■■□□□ 1.69
VGF-201ENST00000249330 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
VGF-201ENST00000249330 TMEM94Q12767 1356 aa25.58■■□□□ 1.69
VGF-201ENST00000249330 PLEKHG5O94827 1062 aa25.57■■□□□ 1.68
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VGF-201ENST00000249330 AAMPQ13685 434 aa25.57■■□□□ 1.68
VGF-201ENST00000249330 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.57■■□□□ 1.68
VGF-201ENST00000249330 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.57■■□□□ 1.68
VGF-201ENST00000249330 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
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VGF-201ENST00000249330 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.56■■□□□ 1.68
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VGF-201ENST00000249330 NFE2L2Q16236 605 aa25.54■■□□□ 1.68
VGF-201ENST00000249330 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.54■■□□□ 1.68
VGF-201ENST00000249330 SBNO1A3KN83 1393 aa25.52■■□□□ 1.68
VGF-201ENST00000249330 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
VGF-201ENST00000249330 FLT4P35916 1363 aa25.52■■□□□ 1.68
VGF-201ENST00000249330 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 ATF3P18847 181 aa25.51■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.51■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.5■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.5■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 FAM83GA6ND36 823 aa25.49■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 HOXC9P31274 260 aa25.49■■□□□ 1.67
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VGF-201ENST00000249330 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.48■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.48■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.48■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.47■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
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VGF-201ENST00000249330 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.47■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 EYA1Q99502 592 aa25.47■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.47■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.46■■□□□ 1.67
VGF-201ENST00000249330 STRCQ7RTU9 1775 aa25.45■■□□□ 1.66
VGF-201ENST00000249330 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
VGF-201ENST00000249330 IL16Q14005 1332 aa25.45■■□□□ 1.66
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VGF-201ENST00000249330 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
VGF-201ENST00000249330 MST1RQ04912 1400 aa25.43■■□□□ 1.66
VGF-201ENST00000249330 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.43■■□□□ 1.66
VGF-201ENST00000249330 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
VGF-201ENST00000249330 TNNQ9UQP3 1299 aa25.41■■□□□ 1.66
VGF-201ENST00000249330 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.41■■□□□ 1.66
VGF-201ENST00000249330 GCP02774 474 aa25.4■■□□□ 1.66
VGF-201ENST00000249330 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.4■■□□□ 1.66
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