RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.62■□□□□ 0.89
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CTDP1-201ENST00000075430 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC27Q2M243 656 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDP1-201ENST00000075430 SHROOM2Q13796 1616 aa20.61■□□□□ 0.89
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CTDP1-201ENST00000075430 UQCRHP07919 91 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDP1-201ENST00000075430 NEK4P51957 841 aa20.61■□□□□ 0.89
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CTDP1-201ENST00000075430 ZNF428Q96B54 188 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDP1-201ENST00000075430 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.59■□□□□ 0.89
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CTDP1-201ENST00000075430 ST18O60284 1047 aa20.54■□□□□ 0.88
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CTDP1-201ENST00000075430 A0A1W2PP64 1363 aa20.54■□□□□ 0.88
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CTDP1-201ENST00000075430 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-201ENST00000075430 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-201ENST00000075430 SDSP20132 328 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-201ENST00000075430 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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CTDP1-201ENST00000075430 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CTDP1-201ENST00000075430 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDP1-201ENST00000075430 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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CTDP1-201ENST00000075430 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.53■□□□□ 0.88
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CTDP1-201ENST00000075430 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.51■□□□□ 0.87
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CTDP1-201ENST00000075430 C14orf37Q86TY3 774 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDP1-201ENST00000075430 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDP1-201ENST00000075430 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
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CTDP1-201ENST00000075430 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.48■□□□□ 0.87
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CTDP1-201ENST00000075430 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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CTDP1-201ENST00000075430 MYOM1P52179 1685 aa20.46■□□□□ 0.87
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CTDP1-201ENST00000075430 SLC4A2P04920 1241 aa20.45■□□□□ 0.86
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CTDP1-201ENST00000075430 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 MYOM2P54296 1465 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 CEP152O94986 1710 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 KIF1BO60333 1816 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 SPC24Q8NBT2 197 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 TMX3Q96JJ7 454 aa20.42■□□□□ 0.86
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