RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam184bQ0KK56 942 aa30.51■■■□□ 2.47
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pnpla7A2AJ88 1352 aa30.5■■■□□ 2.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FanciQ8K368 1330 aa30.49■■■□□ 2.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ptpn23Q6PB44 1692 aa30.49■■■□□ 2.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf335A2A5K6 1337 aa30.48■■■□□ 2.47
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnh5Q920E3 988 aa30.48■■■□□ 2.47
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nlgn1Q99K10 843 aa30.45■■■□□ 2.47
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kif16bB1AVY7 1312 aa30.43■■■□□ 2.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arfgef2A2A5R2 1792 aa30.42■■■□□ 2.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rad23bP54728 416 aa30.42■■■□□ 2.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q8BT18 775 aa30.42■■■□□ 2.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fmnl2A2APV2 1086 aa30.41■■■□□ 2.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Exoc5Q3TPX4 708 aa30.41■■■□□ 2.46
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TatQ8QZR1 454 aa30.4■■■□□ 2.46
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FocadA2AKG8 1798 aa30.36■■■□□ 2.45
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cabp4Q8VHC5 271 aa30.34■■■□□ 2.45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CrklP47941 303 aa30.33■■■□□ 2.45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fchsd2Q3USJ8 740 aa30.33■■■□□ 2.45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Emilin1Q99K41 1017 aa30.33■■■□□ 2.45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slit1Q80TR4 1531 aa30.32■■■□□ 2.44
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam198bQ3UPI1 517 aa30.32■■■□□ 2.44
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 OptnQ8K3K8 584 aa30.32■■■□□ 2.44
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ankrd13dQ6PD24 605 aa30.31■■■□□ 2.44
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zpr1Q62384 459 aa30.3■■■□□ 2.44
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 IncenpQ9WU62 880 aa30.27■■■□□ 2.44
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cnga1P29974 684 aa30.26■■■□□ 2.43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ubr1O70481 1757 aa30.26■■■□□ 2.43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnh4A2A5F7 1018 aa30.24■■■□□ 2.43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem132eQ6IEE6 982 aa30.24■■■□□ 2.43
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Plekhd1B2RPU2 505 aa30.22■■■□□ 2.43
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sos2Q02384 1333 aa30.21■■■□□ 2.43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 InsrP15208 1372 aa30.2■■■□□ 2.43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Map2P20357 1828 aa30.19■■■□□ 2.42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abca3Q8R420 1704 aa30.19■■■□□ 2.42
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zranb3Q6NZP1 1069 aa30.17■■■□□ 2.42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Scn7aB1AYL1 1681 aa30.17■■■□□ 2.42
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ano8Q6PB70 1060 aa30.16■■■□□ 2.42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppm1fQ8CGA0 452 aa30.16■■■□□ 2.42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa30.13■■■□□ 2.41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Magea6O89010 325 aa30.11■■■□□ 2.41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ErfeQ6PGN1 340 aa30.11■■■□□ 2.41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Magea3Q6T340 320 aa30.11■■■□□ 2.41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Usp21Q9QZL6 566 aa30.1■■■□□ 2.41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gpr162Q3UN16 588 aa30.07■■■□□ 2.4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa30.07■■■□□ 2.4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa30.07■■■□□ 2.4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Chrna2Q91X60 512 aa30.05■■■□□ 2.4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col15a1O35206 1367 aa30.04■■■□□ 2.4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rock2P70336 1388 aa30.04■■■□□ 2.4
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa30.03■■■□□ 2.4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam122aQ9DB52 284 aa30.03■■■□□ 2.4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CemipQ8BI06 1361 aa30.02■■■□□ 2.4
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam50bQ9WTJ8 334 aa29.98■■■□□ 2.39
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TkfcQ8VC30 578 aa29.97■■■□□ 2.39
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Socs7Q8VHQ2 579 aa29.97■■■□□ 2.39
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Msl1Q6PDM1 616 aa29.95■■■□□ 2.39
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa29.94■■■□□ 2.38
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm10471E9Q1C7 252 aa29.94■■■□□ 2.38
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnn1Q9EQR3 537 aa29.94■■■□□ 2.38
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Igsf1Q7TQA1 1317 aa29.94■■■□□ 2.38
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MeiocA2AG06 965 aa29.93■■■□□ 2.38
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
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