Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS00

Zdbf2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdbf2Q5SS00 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.8■■■■■ 5.4
Zdbf2Q5SS00 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Zdbf2Q5SS00 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Zdbf2Q5SS00 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
Zdbf2Q5SS00 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Zdbf2Q5SS00 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Zdbf2Q5SS00 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Zdbf2Q5SS00 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
Zdbf2Q5SS00 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Zdbf2Q5SS00 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Zdbf2Q5SS00 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
Zdbf2Q5SS00 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Zdbf2Q5SS00 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
Zdbf2Q5SS00 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Zdbf2Q5SS00 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Zdbf2Q5SS00 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Zdbf2Q5SS00 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Zdbf2Q5SS00 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Zdbf2Q5SS00 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
Zdbf2Q5SS00 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Zdbf2Q5SS00 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Zdbf2Q5SS00 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Zdbf2Q5SS00 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Zdbf2Q5SS00 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Zdbf2Q5SS00 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Zdbf2Q5SS00 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Zdbf2Q5SS00 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Zdbf2Q5SS00 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Zdbf2Q5SS00 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Zdbf2Q5SS00 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Zdbf2Q5SS00 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Zdbf2Q5SS00 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Zdbf2Q5SS00 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Zdbf2Q5SS00 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Zdbf2Q5SS00 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Zdbf2Q5SS00 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Zdbf2Q5SS00 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Zdbf2Q5SS00 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Zdbf2Q5SS00 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Zdbf2Q5SS00 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Zdbf2Q5SS00 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Zdbf2Q5SS00 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Zdbf2Q5SS00 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Zdbf2Q5SS00 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Zdbf2Q5SS00 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Zdbf2Q5SS00 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Zdbf2Q5SS00 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Zdbf2Q5SS00 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Zdbf2Q5SS00 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Zdbf2Q5SS00 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Zdbf2Q5SS00 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Zdbf2Q5SS00 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Zdbf2Q5SS00 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Zdbf2Q5SS00 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Zdbf2Q5SS00 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Zdbf2Q5SS00 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Zdbf2Q5SS00 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Zdbf2Q5SS00 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Zdbf2Q5SS00 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Zdbf2Q5SS00 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Zdbf2Q5SS00 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Zdbf2Q5SS00 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Zdbf2Q5SS00 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Zdbf2Q5SS00 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Zdbf2Q5SS00 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
Zdbf2Q5SS00 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Zdbf2Q5SS00 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Zdbf2Q5SS00 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Zdbf2Q5SS00 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Zdbf2Q5SS00 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Zdbf2Q5SS00 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Zdbf2Q5SS00 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Zdbf2Q5SS00 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Zdbf2Q5SS00 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Zdbf2Q5SS00 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Zdbf2Q5SS00 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Zdbf2Q5SS00 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Zdbf2Q5SS00 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Zdbf2Q5SS00 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Zdbf2Q5SS00 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Zdbf2Q5SS00 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Zdbf2Q5SS00 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Zdbf2Q5SS00 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Zdbf2Q5SS00 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Zdbf2Q5SS00 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Zdbf2Q5SS00 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Zdbf2Q5SS00 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Zdbf2Q5SS00 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Zdbf2Q5SS00 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Zdbf2Q5SS00 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Zdbf2Q5SS00 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Zdbf2Q5SS00 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Zdbf2Q5SS00 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Zdbf2Q5SS00 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Zdbf2Q5SS00 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Zdbf2Q5SS00 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Zdbf2Q5SS00 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Zdbf2Q5SS00 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Zdbf2Q5SS00 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Zdbf2Q5SS00 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms