RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171735.1

Nisch-221, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 1,763 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-221ENSMUST00000171735 NrdcQ8BHG1 1161 aa22.32■■□□□ 1.16
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slx1bQ8BX32 270 aa22.32■■□□□ 1.16
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ptpn23Q6PB44 1692 aa22.3■■□□□ 1.16
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pard3Q99NH2 1333 aa22.3■■□□□ 1.16
Nisch-221ENSMUST00000171735 Parp14Q2EMV9 1817 aa22.3■■□□□ 1.16
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccne1Q61457 408 aa22.3■■□□□ 1.16
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slc12a5Q91V14 1138 aa22.3■■□□□ 1.16
Nisch-221ENSMUST00000171735 Csrnp3P59055 597 aa22.29■■□□□ 1.16
Nisch-221ENSMUST00000171735 Eif4a2P10630 407 aa22.28■■□□□ 1.16
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rsph6aQ8CDR2 708 aa22.28■■□□□ 1.16
Nisch-221ENSMUST00000171735 GsdmaQ9EST1 446 aa22.27■■□□□ 1.16
Nisch-221ENSMUST00000171735 Atf7ipQ7TT18 1306 aa22.26■■□□□ 1.15
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa22.25■■□□□ 1.15
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tsen2Q6P7W5 460 aa22.25■■□□□ 1.15
Nisch-221ENSMUST00000171735 OptnQ8K3K8 584 aa22.25■■□□□ 1.15
Nisch-221ENSMUST00000171735 CrklP47941 303 aa22.24■■□□□ 1.15
Nisch-221ENSMUST00000171735 RgmbQ7TQ33 436 aa22.24■■□□□ 1.15
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zscan21Q07231 555 aa22.22■■□□□ 1.15
Nisch-221ENSMUST00000171735 Psrc1Q9D0P7 329 aa22.22■■□□□ 1.15
Nisch-221ENSMUST00000171735 Eya1P97767 591 aa22.2■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Eno4Q8C042 619 aa22.2■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 TkfcQ8VC30 578 aa22.2■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zeb2Q9R0G7 1215 aa22.2■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slit1Q80TR4 1531 aa22.2■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 FocadA2AKG8 1798 aa22.2■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Shank2Q80Z38 1476 aa22.2■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 InhbeO08717 350 aa22.2■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 PalmQ9Z0P4 383 aa22.19■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zfp777B9EKF4 885 aa22.18■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Col15a1O35206 1367 aa22.18■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kdm6aO70546 1401 aa22.18■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 MpripP97434 1024 aa22.17■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Aplp2Q06335 707 aa22.17■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dmrt2Q8BG36 561 aa22.17■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Plekhd1B2RPU2 505 aa22.16■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Spef2Q8C9J3 1734 aa22.15■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fbln2P37889 1221 aa22.15■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pak3Q61036 559 aa22.15■■□□□ 1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc129Q14B48 1034 aa22.14■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zranb3Q6NZP1 1069 aa22.12■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fer1l6E0CZ42 1862 aa22.11■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Akap11E9Q777 1895 aa22.11■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10471E9Q1C7 252 aa22.11■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zpr1Q62384 459 aa22.11■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cacna1sQ02789 1880 aa22.11■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Simc1E9Q6E9 1354 aa22.11■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kat6bQ8BRB7 1872 aa22.1■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Esx1O88933 382 aa22.1■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa22.1■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pm20d1Q8C165 503 aa22.1■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fchsd2Q3USJ8 740 aa22.09■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mcm10Q0VBD2 885 aa22.08■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 Plin1Q8CGN5 517 aa22.08■■□□□ 1.13
Nisch-221ENSMUST00000171735 TnikP83510 1323 aa22.07■■□□□ 1.12
Nisch-221ENSMUST00000171735 Golga2Q921M4 999 aa22.07■■□□□ 1.12
Nisch-221ENSMUST00000171735 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa22.05■■□□□ 1.12
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa22.04■■□□□ 1.12
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa22.04■■□□□ 1.12
Nisch-221ENSMUST00000171735 Apaf1O88879 1249 aa22.04■■□□□ 1.12
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ltbp1Q8CG19 1712 aa22.03■■□□□ 1.12
Nisch-221ENSMUST00000171735 Stk31Q99MW1 1018 aa22.03■■□□□ 1.12
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mast2Q60592 1734 aa22.03■■□□□ 1.12
Nisch-221ENSMUST00000171735 Q4VA45 678 aa22.02■■□□□ 1.12
Nisch-221ENSMUST00000171735 HypkQ9CR41 129 aa22.02■■□□□ 1.12
Nisch-221ENSMUST00000171735 ThemisQ8BGW0 636 aa22.02■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa22.02■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa22.01■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa22■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fam50bQ9WTJ8 334 aa22■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Iqcf3Q9D498 203 aa21.99■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Znf541Q0GGX2 1363 aa21.99■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Arfgef2A2A5R2 1792 aa21.99■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Usp19Q3UJD6 1360 aa21.98■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa21.98■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa21.97■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ginm1Q91WR6 327 aa21.97■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cabp2Q9JLK4 216 aa21.97■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tnks1bp1P58871 1720 aa21.97■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mst1rQ62190 1378 aa21.97■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ofd1Q80Z25 1017 aa21.97■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vps33bP59016 617 aa21.96■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Uspl1Q3ULM6 1089 aa21.96■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ankrd23Q812A3 306 aa21.96■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Amotl1Q9D4H4 968 aa21.96■■□□□ 1.11
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kcnh4A2A5F7 1018 aa21.94■■□□□ 1.1
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nwd2Q6P5U7 1742 aa21.94■■□□□ 1.1
Nisch-221ENSMUST00000171735 Calr4Q3TQS0 420 aa21.94■■□□□ 1.1
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trpm3Q5F4S9 1721 aa21.93■■□□□ 1.1
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cavin4A2AMM0 362 aa21.93■■□□□ 1.1
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sik1Q60670 779 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.6 ms