RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077257.11

Rxra-201, Transcript of Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rxra, Length 4,905 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rxra-201ENSMUST00000077257 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa22.27■■□□□ 1.16
Rxra-201ENSMUST00000077257 Gli2Q0VGT2 1544 aa22.27■■□□□ 1.16
Rxra-201ENSMUST00000077257 Rnf20Q5DTM8 973 aa22.27■■□□□ 1.16
Rxra-201ENSMUST00000077257 Lrrc43Q3V0L5 667 aa22.26■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Kif24Q6NWW5 1356 aa22.26■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Q7TT23 1179 aa22.26■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 IncenpQ9WU62 880 aa22.26■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Tpd52l1O54818 204 aa22.25■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Myo1bP46735 1107 aa22.25■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Terf1P70371 421 aa22.25■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ano8Q6PB70 1060 aa22.25■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Mical1Q8VDP3 1048 aa22.25■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Myd88P22366 296 aa22.24■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Pcmtd1P59913 357 aa22.23■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cetn4Q8K4K1 168 aa22.23■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Me1P06801 572 aa22.23■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 TbcaP48428 108 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cep170Q6A065 1588 aa22.23■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Naip5Q9R016 1403 aa22.22■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Gsdma2Q32M21 443 aa22.22■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 GptQ8QZR5 496 aa22.22■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Trim58Q5NCC9 485 aa22.22■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Kiaa0753Q6A000 959 aa22.22■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 EspnQ9ET47 871 aa22.22■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cyp7a1Q64505 503 aa22.21■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cers3Q1A3B0 383 aa22.21■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa22.21■■□□□ 1.15
Rxra-201ENSMUST00000077257 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cplx1P63040 134 aa22.2■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Soga3Q6NZL0 945 aa22.2■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Kifc2O08672 792 aa22.2■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa22.2■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 PzpQ61838 1495 aa22.2■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Depdc5P61460 1591 aa22.2■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Polr3dQ91WD1 398 aa22.2■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Hfm1D3Z4R1 1434 aa22.2■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Hap1O35668 628 aa22.19■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Lmod3E9QA62 571 aa22.18■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Hmox1P14901 289 aa22.18■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Miga2Q8BK03 593 aa22.18■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 CrklP47941 303 aa22.18■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Efcab2Q9CQ46 164 aa22.18■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Plekhg5Q66T02 1073 aa22.18■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 BccipQ9CWI3 316 aa22.18■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Q9D2X8 372 aa22.17■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Spg7Q3ULF4 781 aa22.17■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Abcc2Q8VI47 1543 aa22.17■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ddx58Q6Q899 926 aa22.17■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Slc12a5Q91V14 1138 aa22.17■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Hdac9Q99N13 588 aa22.17■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Magi3Q9EQJ9 1476 aa22.17■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cwc27Q3TKY6 469 aa22.16■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Stk3Q9JI10 497 aa22.16■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Prr29B1ARI9 187 aa22.16■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa22.16■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Sel1lQ9Z2G6 790 aa22.16■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 BC005561E9Q5E2 1589 aa22.16■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Htatsf1Q8BGC0 757 aa22.16■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Dydc2Q9D3X8 139 aa22.16■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 ThemisQ8BGW0 636 aa22.15■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Pim2Q62070 370 aa22.15■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ppp4r3bQ922R5 820 aa22.15■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Atp6v1dP57746 247 aa22.14■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ankle2Q6P1H6 964 aa22.14■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
Rxra-201ENSMUST00000077257 Spryd3E9Q9B3 442 aa22.13■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Talpid3E9PV87 1520 aa22.13■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Slc7a3P70423 618 aa22.13■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa22.13■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 VgfQ0VGU4 617 aa22.12■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 GpkowQ56A08 488 aa22.12■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Atp2b4Q6Q477 1205 aa22.12■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 NsmfQ99NF2 532 aa22.12■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Odf2lQ9D478 642 aa22.12■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Atp7aQ64430 1491 aa22.11■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ccdc178Q8CDV0 866 aa22.11■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa22.11■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 ParvgQ9ERD8 331 aa22.11■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Idi1P58044 227 aa22.1■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Mcm10Q0VBD2 885 aa22.1■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ppp1r1bQ60829 194 aa22.1■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Supt16hQ920B9 1047 aa22.1■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Tom1l2Q5SRX1 507 aa22.1■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Wdr17E9Q271 1322 aa22.1■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Podxl2Q8CAE9 603 aa22.09■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Hoxb7P09024 217 aa22.09■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.8 ms