RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa31.16■■■□□ 2.58
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GakQ99KY4 1305 aa30.89■■■□□ 2.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kdm6aO70546 1401 aa30.87■■■□□ 2.53
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ildr2B5TVM2 661 aa30.85■■■□□ 2.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Parp14Q2EMV9 1817 aa30.84■■■□□ 2.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim28Q62318 834 aa30.84■■■□□ 2.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Simc1E9Q6E9 1354 aa30.83■■■□□ 2.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrit1Q8K099 624 aa30.83■■■□□ 2.53
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa30.81■■■□□ 2.52
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eif4a2P10630 407 aa30.81■■■□□ 2.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp1r15aP17564 657 aa30.81■■■□□ 2.52
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eya1P97767 591 aa30.78■■■□□ 2.52
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp777B9EKF4 885 aa30.71■■■□□ 2.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Speer4bQ9D9F7 267 aa30.71■■■□□ 2.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bsdc1Q80Y55 427 aa30.7■■■□□ 2.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arfgef2A2A5R2 1792 aa30.69■■■□□ 2.5
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgap33Q80YF9 1305 aa30.67■■■□□ 2.5
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MpripP97434 1024 aa30.65■■■□□ 2.5
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc12a5Q91V14 1138 aa30.65■■■□□ 2.5
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pnpla7A2AJ88 1352 aa30.65■■■□□ 2.5
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa30.65■■■□□ 2.5
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ApobrQ8VBT6 942 aa30.51■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tns2Q8CGB6 1400 aa30.5■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plin1Q8CGN5 517 aa30.5■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ciz1Q8VEH2 845 aa30.49■■■□□ 2.47
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
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