RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 PTPRDP23468 1912 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 CST8O60676 142 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 PEX2P28328 305 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 CDH6P55285 790 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 TLE2Q04725 743 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 CALCOCO2Q13137 446 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 LLGL1Q15334 1064 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 UTS2BQ765I0 119 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 DEFB106AQ8N104 65 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 ALLCQ8N6M5 410 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 PARVBQ9HBI1 364 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 USP3Q9Y6I4 520 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 A0A0G2JND7 137 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 TADA2AO75478 443 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 IVDP26440 423 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 KLRC2P26717 231 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 GSSP48637 474 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 23.5
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM60Q495X7 471 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 HIPK4Q8NE63 616 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 RNF157Q96PX1 679 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 PANX3Q96QZ0 392 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 PALMDQ9NP74 551 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 TTC3P53804 2025 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 CD48P09326 243 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 TGM2P21980 687 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 IL4RP24394 825 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 AP2B1P63010 937 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 IL9RQ01113 521 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 KRT81Q14533 505 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 TCTN1Q2MV58 587 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 RFX6Q8HWS3 928 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 KCNK16Q96T55 309 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 ARMCX1Q9P291 453 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 OR6C75A6NL08 312 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 NRP1O14786 923 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 TMCC2O75069 709 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 ACADVLP49748 655 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 ZBTB17Q13105 803 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 SPIDRQ14159 915 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 ADRM1Q16186 407 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 CALN1Q9BXU9 219 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 AK5Q9Y6K8 562 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 A0A1B0GTW7 788 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 CHEK2O96017 543 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 ATF2P15336 505 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 FGFR3P22607 806 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 NDUFV1P49821 464 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 SULT1E1P49888 294 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 FOLH1Q04609 750 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 ZBTB16Q05516 673 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 SMARCB1Q12824 385 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 CYP2A13Q16696 494 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 KYNUQ16719 465 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 RAB6CQ53S08 254 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 POTEHQ6S545 545 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-201ENST00000317201 USP43Q70EL4 1123 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 281.9 ms