RNA–Protein interactions for RNA: YNL089C

YNL089C, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YNL089C, Length 477 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL089C	YNL089C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL089C	YNL089C	SOG2	Q08817	791 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL089C	YNL089C	FUS1	P11710	512 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL089C	YNL089C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL089C	YNL089C	SMC1	P32908	1225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL089C	YNL089C	NTA1	P40354	457 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL089C	YNL089C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL089C	YNL089C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL089C	YNL089C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL089C	YNL089C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL089C	YNL089C	APC11	Q12157	165 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL089C	YNL089C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	PAN5	P38787	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	IRC24	P40580	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	RAD55	P38953	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	RGD2	P43556	714 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	REC8	Q12188	680 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	LIP5	P32875	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	ALD3	P54114	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
YNL089C	YNL089C	TOS1	P38288	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	AKR1	P39010	764 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	FAR11	P53917	953 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
YNL089C	YNL089C	TRP3	P00937	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	YKR073C	P36153	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	PSY2	P40164	858 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	NEO1	P40527	1151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	SPO74	P45819	413 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	YGR130C	P53278	816 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	ELG1	Q12050	791 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	TFA2	P36145	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	HAT1	Q12341	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL089C	YNL089C	YJR124C	P47159	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	NCE103	P53615	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	CYC7	P00045	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	FET4	P40988	552 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	NSI1	Q12457	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	KTR2	P33550	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	AVT1	P47082	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	UFD2	P54860	961 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	GIC2	Q06648	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	GLO4	Q12320	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	RPB10	P22139	70 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	AOS1	Q06624	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	ERS1	P17261	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	SLD2	P34252	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	ERP5	P38819	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	BOL3	P39724	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	ELM1	P32801	640 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	CTH1	P47976	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	GCV1	P48015	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	KAR5	Q04746	504 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL089C	YNL089C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	MMM1	P41800	426 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	CIT3	P43635	486 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	ATG1	P53104	897 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	RSC4	Q02206	625 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	YIG1	Q08956	461 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	QDR1	P40475	563 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	ACF4	P47129	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	IPL1	P38991	367 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	MDJ2	P42834	146 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	YHL050C	P38721	697 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	YHR219W	P38900	624 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	ECL1	P48235	211 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	YNL011C	P53980	444 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	NPR1	P22211	790 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	HEM3	P28789	327 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	SEC20	P28791	383 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	GPT2	P36148	743 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL089C	YNL089C	RIM11	P38615	370 aa		4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.4 ms