RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	CTR9	P89105	1077 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YLR224W	YLR224W	RSC2	Q06488	889 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YLR224W	YLR224W	TRP3	P00937	484 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	SFA1	P32771	386 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	DUR3	P33413	735 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	PSY2	P40164	858 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	KAR5	Q04746	504 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	SOG2	Q08817	791 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	SLP1	Q12232	587 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	YJR124C	P47159	448 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	COB	P00163	385 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	HVG1	P0CE11	249 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	MAC1	P35192	417 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	YNR065C	P53751	1116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	GLO4	Q12320	285 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	FUS1	P11710	512 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	QDR1	P40475	563 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	REC8	Q12188	680 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	YLR122C	Q12312	125 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	HAT1	Q12341	374 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	INP52	P50942	1183 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	GUP1	P53154	560 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	MNL2	Q12205	849 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	ERS1	P17261	260 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	RSC6	P25632	483 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	SMC1	P32908	1225 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	YKR073C	P36153	106 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	ERP5	P38819	212 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	NEO1	P40527	1151 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	NCE103	P53615	221 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YLR224W	YLR224W	OMA1	P36163	345 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	AKR1	P39010	764 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	DSE4	P53753	1117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
YLR224W	YLR224W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	COQ2	P32378	372 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	YBR287W	P38355	427 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	CTH1	P47976	325 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	RSC4	Q02206	625 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	ELG1	Q12050	791 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	KAE1	P36132	386 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	SAF1	P38352	637 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	MDJ2	P42834	146 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	ATG1	P53104	897 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	YGR130C	P53278	816 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	SEA4	P38164	1038 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	FRT1	Q99332	602 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	RIM11	P38615	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR224W	YLR224W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	LEM3	P42838	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	ACF4	P47129	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	MED7	Q08278	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	NPR1	P22211	790 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	FET4	P40988	552 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	YNL011C	P53980	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	CHS2	P14180	963 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	TOS1	P38288	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	NUT2	Q06213	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	UFD2	P54860	961 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	CYC7	P00045	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	FLP1	P03870	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
YLR224W	YLR224W	YHL050C	P38721	697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	YHR219W	P38900	624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	LIP5	P32875	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	GPT2	P36148	743 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	IRC24	P40580	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	SPO74	P45819	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	SDH1	Q00711	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	GIC2	Q06648	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLR224W	YLR224W	MON1	P53129	644 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	WHI5	Q12416	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	YHL008C	P38750	627 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	CDC55	Q00362	526 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	EAR1	Q03212	550 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	YML020W	Q03722	664 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.4 ms