RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
HCG18-241ENST00000602290 KNDC1Q76NI1 1749 aa18.17■□□□□ 0.5
HCG18-241ENST00000602290 NUP155O75694 1391 aa18.17■□□□□ 0.5
HCG18-241ENST00000602290 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.16■□□□□ 0.5
HCG18-241ENST00000602290 ALS2Q96Q42 1657 aa18.15■□□□□ 0.5
HCG18-241ENST00000602290 MAP3K5Q99683 1374 aa18.15■□□□□ 0.5
HCG18-241ENST00000602290 PLEKHG5O94827 1062 aa18.14■□□□□ 0.49
HCG18-241ENST00000602290 PSME1Q06323 249 aa18.14■□□□□ 0.49
HCG18-241ENST00000602290 IFT172Q9UG01 1749 aa18.13■□□□□ 0.49
HCG18-241ENST00000602290 SGIP1Q9BQI5 828 aa18.13■□□□□ 0.49
HCG18-241ENST00000602290 KIF1BO60333 1816 aa18.12■□□□□ 0.49
HCG18-241ENST00000602290 VGFO15240 615 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HCG18-241ENST00000602290 ZBTB7AO95365 584 aa18.12■□□□□ 0.49
HCG18-241ENST00000602290 PHF8Q9UPP1 1060 aa18.12■□□□□ 0.49
HCG18-241ENST00000602290 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HCG18-241ENST00000602290 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.11■□□□□ 0.49
HCG18-241ENST00000602290 ROCK1Q13464 1354 aa18.11■□□□□ 0.49
HCG18-241ENST00000602290 PPLO60437 1756 aa18.11■□□□□ 0.49
HCG18-241ENST00000602290 PEAK1Q9H792 1746 aa18.1■□□□□ 0.49
HCG18-241ENST00000602290 ABCC11Q96J66 1382 aa18.07■□□□□ 0.48
HCG18-241ENST00000602290 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.07■□□□□ 0.48
HCG18-241ENST00000602290 BARGINQ6ZT62 677 aa18.07■□□□□ 0.48
HCG18-241ENST00000602290 HSPA6P17066 643 aa18.05■□□□□ 0.48
HCG18-241ENST00000602290 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
HCG18-241ENST00000602290 PLSCR1O15162 318 aa18.04■□□□□ 0.48
HCG18-241ENST00000602290 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
HCG18-241ENST00000602290 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa18.03■□□□□ 0.48
HCG18-241ENST00000602290 PDE3BQ13370 1112 aa18.03■□□□□ 0.48
HCG18-241ENST00000602290 SSH2Q76I76 1423 aa18.02■□□□□ 0.48
HCG18-241ENST00000602290 PRDM11Q9NQV5 511 aa18.02■□□□□ 0.48
HCG18-241ENST00000602290 MTFR1LQ9H019 292 aa18.01■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa18■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa18■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 OVOS2Q6IE36 1432 aa18■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 ANKARQ7Z5J8 1434 aa18■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 SLC34A2O95436 690 aa18■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 KIAA0232Q92628 1395 aa18■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 SBF2Q86WG5 1849 aa18■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 PROM2Q8N271 834 aa17.99■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 STK26Q9P289 416 aa17.98■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 ATP7BP35670 1465 aa17.97■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 ATP10DQ9P241 1426 aa17.97■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 ARXQ96QS3 562 aa17.96■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 LRRC37A3O60309 1634 aa17.96■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 LMO7Q8WWI1 1683 aa17.96■□□□□ 0.47
HCG18-241ENST00000602290 GPR162Q16538 588 aa17.95■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 STRN4Q9NRL3 753 aa17.95■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 PAPPAQ13219 1627 aa17.94■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 PTF1AQ7RTS3 328 aa17.94■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 USP35Q9P2H5 1018 aa17.94■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17.94■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 CHRNA2Q15822 529 aa17.93■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 SLC15A2Q16348 729 aa17.93■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 TCP11L2Q8N4U5 519 aa17.93■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa17.93■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 SIRT1Q96EB6 747 aa17.93■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 AATKQ6ZMQ8 1374 aa17.92■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 PIK3C2GO75747 1445 aa17.92■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 ADCY9O60503 1353 aa17.91■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 BCL9O00512 1426 aa17.91■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 COL24A1Q17RW2 1714 aa17.9■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 STK32BQ9NY57 414 aa17.9■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 GPRASP1Q5JY77 1395 aa17.9■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
HCG18-241ENST00000602290 TMEM132EQ6IEE7 984 aa17.89■□□□□ 0.45
HCG18-241ENST00000602290 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
HCG18-241ENST00000602290 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
HCG18-241ENST00000602290 PRELPP51888 382 aa17.88■□□□□ 0.45
HCG18-241ENST00000602290 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
HCG18-241ENST00000602290 TXNRD1Q16881 649 aa17.86■□□□□ 0.45
HCG18-241ENST00000602290 CAPN15O75808 1086 aa17.85■□□□□ 0.45
HCG18-241ENST00000602290 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa17.85■□□□□ 0.45
HCG18-241ENST00000602290 PRR36Q9H6K5 1346 aa17.85■□□□□ 0.45
HCG18-241ENST00000602290 TULP4Q9NRJ4 1543 aa17.84■□□□□ 0.45
HCG18-241ENST00000602290 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
HCG18-241ENST00000602290 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa17.83■□□□□ 0.45
HCG18-241ENST00000602290 CPDO75976 1380 aa17.83■□□□□ 0.45
HCG18-241ENST00000602290 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 WNK3Q9BYP7 1800 aa17.82■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa17.81■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 NLGN2Q8NFZ4 835 aa17.81■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa17.8■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 APLP2Q06481 763 aa17.8■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 CRB1P82279 1406 aa17.8■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 EVA1CP58658 441 aa17.79■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 GRIN3BO60391 1043 aa17.78■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 APLP1P51693 650 aa17.78■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 PCNTO95613 3336 aa17.77■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 PRAM1Q96QH2 718 aa17.77■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 QSER1Q2KHR3 1735 aa17.77■□□□□ 0.44
HCG18-241ENST00000602290 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
HCG18-241ENST00000602290 AKAP12Q02952 1782 aa17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms