RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 USP6P35125 1406 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-209ENST00000547449 ERICH6BQ5W0A0 696 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-209ENST00000547449 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-209ENST00000547449 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CS-209ENST00000547449 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CS-209ENST00000547449 CCDC146Q8IYE0 955 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-209ENST00000547449 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-209ENST00000547449 RNF123Q5XPI4 1314 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-209ENST00000547449 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-209ENST00000547449 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-209ENST00000547449 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.9□□□□□ -0.34
CS-209ENST00000547449 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-209ENST00000547449 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-209ENST00000547449 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 GOLGA2Q08379 1002 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 USP31Q70CQ4 1352 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 SLFN5Q08AF3 891 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 CCDC27Q2M243 656 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 PHF8Q9UPP1 1060 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 AKAP12Q02952 1782 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 NWD1Q149M9 1564 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 FCHSD2O94868 740 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 FBLN1P23142 703 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 TCP11L2Q8N4U5 519 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 C19orf44Q9H6X5 657 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 PLEKHF1Q96S99 279 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 OVOS2Q6IE36 1432 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 SHPRHQ149N8 1683 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 E9PSI1 815 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 IL13P35225 146 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 HSPA2P54652 639 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 C14orf37Q86TY3 774 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 WDR63Q8IWG1 891 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 WWC1Q8IX03 1113 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 RCAN3Q9UKA8 241 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 FMN2Q9NZ56 1722 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 DUSP27Q5VZP5 1158 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-209ENST00000547449 ITSN1Q15811 1721 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 ESCO1Q5FWF5 840 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 NRKQ7Z2Y5 1582 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 IQSEC2Q5JU85 1478 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 NLRP6P59044 892 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 PSME1Q06323 249 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 LMTK3Q96Q04 1460 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 TMPOP42166 694 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 TMEM94Q12767 1356 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 NALCNQ8IZF0 1738 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 ABTB2Q8N961 1025 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 ORAI2Q96SN7 254 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 KIF24Q5T7B8 1368 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 NEFMP07197 916 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 ATF3P18847 181 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 RRP1P56182 461 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 NEUROD2Q15784 382 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 PPP4R2Q9NY27 417 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 MAP3K19Q56UN5 1328 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 DCCP43146 1447 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-209ENST00000547449 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 PRKAR2BP31323 418 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 IL16Q14005 1332 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 SBNO1A3KN83 1393 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 C1orf167Q5SNV9 1468 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 RIPK4P57078 832 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 LRRC7Q96NW7 1537 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 FOXO3O43524 673 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 FLT4P35916 1363 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 AMPHP49418 695 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 NFE2L2Q16236 605 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 KRT28Q7Z3Y7 464 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 MYH16Q9H6N6 1097 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-209ENST00000547449 HMOX1P09601 288 aa12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms