RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 SLAIN2Q9P270 581 aa29.96■■■□□ 2.39
ACER3-202ENST00000525194 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.96■■■□□ 2.39
ACER3-202ENST00000525194 FYB1O15117 783 aa29.95■■■□□ 2.39
ACER3-202ENST00000525194 PSME1Q06323 249 aa29.95■■■□□ 2.39
ACER3-202ENST00000525194 SSH2Q76I76 1423 aa29.94■■■□□ 2.38
ACER3-202ENST00000525194 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.93■■■□□ 2.38
ACER3-202ENST00000525194 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.9■■■□□ 2.38
ACER3-202ENST00000525194 FOXO3O43524 673 aa29.89■■■□□ 2.38
ACER3-202ENST00000525194 NLRP13Q86W25 1043 aa29.89■■■□□ 2.38
ACER3-202ENST00000525194 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.88■■■□□ 2.37
ACER3-202ENST00000525194 NME9Q86XW9 330 aa29.87■■■□□ 2.37
ACER3-202ENST00000525194 COG3Q96JB2 828 aa29.87■■■□□ 2.37
ACER3-202ENST00000525194 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.86■■■□□ 2.37
ACER3-202ENST00000525194 PPP2R1AP30153 589 aa29.85■■■□□ 2.37
ACER3-202ENST00000525194 BRINP3Q76B58 766 aa29.85■■■□□ 2.37
ACER3-202ENST00000525194 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
ACER3-202ENST00000525194 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.84■■■□□ 2.37
ACER3-202ENST00000525194 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
ACER3-202ENST00000525194 USP31Q70CQ4 1352 aa29.82■■■□□ 2.36
ACER3-202ENST00000525194 MRS2Q9HD23 443 aa29.81■■■□□ 2.36
ACER3-202ENST00000525194 ABTB2Q8N961 1025 aa29.8■■■□□ 2.36
ACER3-202ENST00000525194 TOM1O60784 492 aa29.79■■■□□ 2.36
ACER3-202ENST00000525194 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.79■■■□□ 2.36
ACER3-202ENST00000525194 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.79■■■□□ 2.36
ACER3-202ENST00000525194 SBNO1A3KN83 1393 aa29.77■■■□□ 2.36
ACER3-202ENST00000525194 PIK3C2AO00443 1686 aa29.77■■■□□ 2.36
ACER3-202ENST00000525194 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
ACER3-202ENST00000525194 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.36
ACER3-202ENST00000525194 NLRP6P59044 892 aa29.76■■■□□ 2.35
ACER3-202ENST00000525194 USP54Q70EL1 1684 aa29.76■■■□□ 2.35
ACER3-202ENST00000525194 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.75■■■□□ 2.35
ACER3-202ENST00000525194 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
ACER3-202ENST00000525194 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.74■■■□□ 2.35
ACER3-202ENST00000525194 PXDNQ92626 1479 aa29.74■■■□□ 2.35
ACER3-202ENST00000525194 CERKQ8TCT0 537 aa29.72■■■□□ 2.35
ACER3-202ENST00000525194 CCDC184Q52MB2 194 aa29.71■■■□□ 2.35
ACER3-202ENST00000525194 CFAP53Q96M91 514 aa29.71■■■□□ 2.35
ACER3-202ENST00000525194 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.71■■■□□ 2.35
ACER3-202ENST00000525194 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
ACER3-202ENST00000525194 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.69■■■□□ 2.34
ACER3-202ENST00000525194 MTHFSP49914 203 aa29.68■■■□□ 2.34
ACER3-202ENST00000525194 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
ACER3-202ENST00000525194 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.68■■■□□ 2.34
ACER3-202ENST00000525194 ARHGEF10O15013 1369 aa29.67■■■□□ 2.34
ACER3-202ENST00000525194 ALS2Q96Q42 1657 aa29.67■■■□□ 2.34
ACER3-202ENST00000525194 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.67■■■□□ 2.34
ACER3-202ENST00000525194 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.66■■■□□ 2.34
ACER3-202ENST00000525194 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.65■■■□□ 2.34
ACER3-202ENST00000525194 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.65■■■□□ 2.34
ACER3-202ENST00000525194 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.65■■■□□ 2.34
ACER3-202ENST00000525194 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
ACER3-202ENST00000525194 POLKQ9UBT6 870 aa29.63■■■□□ 2.33
ACER3-202ENST00000525194 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
ACER3-202ENST00000525194 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
ACER3-202ENST00000525194 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
ACER3-202ENST00000525194 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
ACER3-202ENST00000525194 USP19O94966 1318 aa29.6■■■□□ 2.33
ACER3-202ENST00000525194 SLIT3O75094 1523 aa29.59■■■□□ 2.33
ACER3-202ENST00000525194 INSRP06213 1382 aa29.58■■■□□ 2.33
ACER3-202ENST00000525194 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.58■■■□□ 2.33
ACER3-202ENST00000525194 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.57■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 PIP4K2BP78356 416 aa29.57■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.327e-25■■■■■ 56.8
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ACER3-202ENST00000525194 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.56■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 SOX12O15370 315 aa29.55■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 FBLN1P23142 703 aa29.55■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.55■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 GCP02774 474 aa29.54■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 NUDCQ9Y266 331 aa29.54■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 NFAT5O94916 1531 aa29.52■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.51■■■□□ 2.32
ACER3-202ENST00000525194 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
ACER3-202ENST00000525194 AMPHP49418 695 aa29.51■■■□□ 2.31
ACER3-202ENST00000525194 PHLPP1O60346 1717 aa29.5■■■□□ 2.31
ACER3-202ENST00000525194 RTL1A6NKG5 1358 aa29.5■■■□□ 2.31
ACER3-202ENST00000525194 FLT4P35916 1363 aa29.5■■■□□ 2.31
ACER3-202ENST00000525194 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
ACER3-202ENST00000525194 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
ACER3-202ENST00000525194 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.45■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 LTN1O94822 1766 aa29.44■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 SHPRHQ149N8 1683 aa29.44■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.44■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 PEAK1Q9H792 1746 aa29.43■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 PLEKHG5O94827 1062 aa29.43■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.43■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 IP6K1Q92551 441 aa29.42■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 HOXC9P31274 260 aa29.41■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.41■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 CPDO75976 1380 aa29.39■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
ACER3-202ENST00000525194 IL13P35225 146 aa29.39■■■□□ 2.3
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