RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514153.5

FAM149A-215, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, human

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene FAM149A, Length 2,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM149A-215	ENST00000514153	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		41.06	■■■■■ 4.16
FAM149A-215	ENST00000514153	MTHFS	P49914	203 aa		41.03	■■■■■ 4.16
FAM149A-215	ENST00000514153	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	41.03	■■■■■ 4.16
FAM149A-215	ENST00000514153	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		41.02	■■■■■ 4.16
FAM149A-215	ENST00000514153	ORAI2	Q96SN7	254 aa		41.01	■■■■■ 4.16
FAM149A-215	ENST00000514153	SSH2	Q76I76	1423 aa		41.01	■■■■■ 4.16
FAM149A-215	ENST00000514153	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		41.01	■■■■■ 4.16
FAM149A-215	ENST00000514153	ATF3	P18847	181 aa		41	■■■■■ 4.15
FAM149A-215	ENST00000514153	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		40.99	■■■■■ 4.15
FAM149A-215	ENST00000514153	FBLN1	P23142	703 aa		40.98	■■■■■ 4.15
FAM149A-215	ENST00000514153	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		40.98	■■■■■ 4.15
FAM149A-215	ENST00000514153	COG3	Q96JB2	828 aa		40.97	■■■■■ 4.15
FAM149A-215	ENST00000514153	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		40.95	■■■■■ 4.15
FAM149A-215	ENST00000514153	MSH6	P52701	1360 aa		40.94	■■■■■ 4.14
FAM149A-215	ENST00000514153	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	40.94	■■■■■ 4.14
FAM149A-215	ENST00000514153	DCC	P43146	1447 aa		40.93	■■■■■ 4.14
FAM149A-215	ENST00000514153	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		40.92	■■■■■ 4.14
FAM149A-215	ENST00000514153	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		40.91	■■■■■ 4.14
FAM149A-215	ENST00000514153	MST1R	Q04912	1400 aa		40.91	■■■■■ 4.14
FAM149A-215	ENST00000514153	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	40.89	■■■■■ 4.14
FAM149A-215	ENST00000514153	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		40.88	■■■■■ 4.13
FAM149A-215	ENST00000514153	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		40.87	■■■■■ 4.13
FAM149A-215	ENST00000514153	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		40.87	■■■■■ 4.13
FAM149A-215	ENST00000514153	FOXO3	O43524	673 aa		40.87	■■■■■ 4.13
FAM149A-215	ENST00000514153	PIK3C2A	O00443	1686 aa		40.86	■■■■■ 4.13
FAM149A-215	ENST00000514153	PSME1	Q06323	249 aa		40.86	■■■■■ 4.13
FAM149A-215	ENST00000514153	CFAP53	Q96M91	514 aa		40.86	■■■■■ 4.13
FAM149A-215	ENST00000514153	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	40.86	■■■■■ 4.13
FAM149A-215	ENST00000514153	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	40.85	■■■■■ 4.13
FAM149A-215	ENST00000514153	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	40.84	■■■■■ 4.13
FAM149A-215	ENST00000514153	SHPRH	Q149N8	1683 aa		40.84	■■■■■ 4.13
FAM149A-215	ENST00000514153	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	40.83	■■■■■ 4.13
FAM149A-215	ENST00000514153	POLK	Q9UBT6	870 aa		40.83	■■■■■ 4.13
FAM149A-215	ENST00000514153	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		40.82	■■■■■ 4.12
FAM149A-215	ENST00000514153	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		40.8	■■■■■ 4.12
FAM149A-215	ENST00000514153	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	40.8	■■■■■ 4.12
FAM149A-215	ENST00000514153	SOX12	O15370	315 aa		40.79	■■■■■ 4.12
FAM149A-215	ENST00000514153	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	40.79	■■■■■ 4.12
FAM149A-215	ENST00000514153	KIF1A	Q12756	1690 aa		40.79	■■■■■ 4.12
FAM149A-215	ENST00000514153	ABTB2	Q8N961	1025 aa		40.78	■■■■■ 4.12
FAM149A-215	ENST00000514153	NLRP6	P59044	892 aa		40.77	■■■■■ 4.12
FAM149A-215	ENST00000514153	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		40.77	■■■■■ 4.12
FAM149A-215	ENST00000514153	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		40.77	■■■■■ 4.12
FAM149A-215	ENST00000514153	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
FAM149A-215	ENST00000514153	USP31	Q70CQ4	1352 aa		40.74	■■■■■ 4.11
FAM149A-215	ENST00000514153	INSR	P06213	1382 aa		40.72	■■■■■ 4.11
FAM149A-215	ENST00000514153	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	40.72	■■■■■ 4.11
FAM149A-215	ENST00000514153	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	40.72	■■■■■ 4.11
FAM149A-215	ENST00000514153	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		40.71	■■■■■ 4.11
FAM149A-215	ENST00000514153	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	40.71	■■■■■ 4.11
FAM149A-215	ENST00000514153	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		40.7	■■■■■ 4.11
FAM149A-215	ENST00000514153	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		40.69	■■■■■ 4.1
FAM149A-215	ENST00000514153	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
FAM149A-215	ENST00000514153	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	40.65	■■■■■ 4.1
FAM149A-215	ENST00000514153	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
FAM149A-215	ENST00000514153	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	40.64	■■■■■ 4.1
FAM149A-215	ENST00000514153	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	40.64	■■■■■ 4.1
FAM149A-215	ENST00000514153	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	40.63	■■■■■ 4.1
FAM149A-215	ENST00000514153	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	40.63	■■■■■ 4.1
FAM149A-215	ENST00000514153	SLAIN2	Q9P270	581 aa		40.63	■■■■■ 4.1
FAM149A-215	ENST00000514153	USP54	Q70EL1	1684 aa		40.63	■■■■■ 4.09
FAM149A-215	ENST00000514153	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		40.63	■■■■■ 4.09
FAM149A-215	ENST00000514153	BRINP3	Q76B58	766 aa		40.61	■■■■■ 4.09
FAM149A-215	ENST00000514153	NUDC	Q9Y266	331 aa		40.61	■■■■■ 4.09
FAM149A-215	ENST00000514153	PLEKHG5	O94827	1062 aa		40.6	■■■■■ 4.09
FAM149A-215	ENST00000514153	PEAK1	Q9H792	1746 aa		40.58	■■■■■ 4.09
FAM149A-215	ENST00000514153	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.57	■■■■■ 4.09
FAM149A-215	ENST00000514153	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		40.57	■■■■■ 4.09
FAM149A-215	ENST00000514153	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		40.57	■■■■■ 4.08
FAM149A-215	ENST00000514153	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
FAM149A-215	ENST00000514153	APAF1	O14727	1248 aa		40.53	■■■■■ 4.08
FAM149A-215	ENST00000514153	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		40.5	■■■■■ 4.07
FAM149A-215	ENST00000514153	IL13	P35225	146 aa		40.49	■■■■■ 4.07
FAM149A-215	ENST00000514153	ALS2	Q96Q42	1657 aa		40.49	■■■■■ 4.07
FAM149A-215	ENST00000514153	PXDN	Q92626	1479 aa		40.49	■■■■■ 4.07
FAM149A-215	ENST00000514153	RUNDC1	Q96C34	613 aa		40.47	■■■■■ 4.07
FAM149A-215	ENST00000514153	AMPH	P49418	695 aa		40.47	■■■■■ 4.07
FAM149A-215	ENST00000514153	SBNO1	A3KN83	1393 aa		40.46	■■■■■ 4.07
FAM149A-215	ENST00000514153	NFAT5	O94916	1531 aa		40.45	■■■■■ 4.07
FAM149A-215	ENST00000514153	FLT4	P35916	1363 aa		40.44	■■■■■ 4.06
FAM149A-215	ENST00000514153	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
FAM149A-215	ENST00000514153	LTN1	O94822	1766 aa		40.42	■■■■■ 4.06
FAM149A-215	ENST00000514153	HMOX1	P09601	288 aa		40.41	■■■■■ 4.06
FAM149A-215	ENST00000514153	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		40.4	■■■■■ 4.06
FAM149A-215	ENST00000514153	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		40.4	■■■■■ 4.06
FAM149A-215	ENST00000514153	GC	P02774	474 aa		40.39	■■■■■ 4.06
FAM149A-215	ENST00000514153	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	40.39	■■■■■ 4.06
FAM149A-215	ENST00000514153	SLIT3	O75094	1523 aa		40.39	■■■■■ 4.06
FAM149A-215	ENST00000514153	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		40.39	■■■■■ 4.06
FAM149A-215	ENST00000514153	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		40.39	■■■■■ 4.06
FAM149A-215	ENST00000514153	USP19	O94966	1318 aa		40.38	■■■■■ 4.06
FAM149A-215	ENST00000514153	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		40.38	■■■■■ 4.06
FAM149A-215	ENST00000514153	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		40.38	■■■■■ 4.05
FAM149A-215	ENST00000514153	NEUROD2	Q15784	382 aa		40.38	■■■■■ 4.05
FAM149A-215	ENST00000514153	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		40.37	■■■■■ 4.05
FAM149A-215	ENST00000514153	HOXC9	P31274	260 aa		40.36	■■■■■ 4.05
FAM149A-215	ENST00000514153	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	40.35	■■■■■ 4.05
FAM149A-215	ENST00000514153	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		40.34	■■■■■ 4.05
FAM149A-215	ENST00000514153	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		40.34	■■■■■ 4.05
FAM149A-215	ENST00000514153	FCHSD2	O94868	740 aa		40.33	■■■■■ 4.05

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