RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP17.04■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 USP32Q8NFA0 1604 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D32Q96NH3 1257 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 PRAM1Q96QH2 718 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 GRPEL1Q9HAV7 217 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 RLBP1P12271 317 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 RARSP54136 660 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 CFAP53Q96M91 514 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 CHMP5Q9NZZ3 219 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 PREX1Q8TCU6 1659 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 NGEFQ8N5V2 710 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 SLC52A1Q9NWF4 448 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 PTPRMP28827 1452 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 ERBB4Q15303 1308 aa16.98■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 PDE3AQ14432 1141 aa16.98■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 FBLN1P23142 703 aa16.97■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.97■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 ABCC11Q96J66 1382 aa16.97■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 FYB1O15117 783 aa16.96■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 WDR63Q8IWG1 891 aa16.96■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa16.96■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.96■□□□□ 0.31
NISCH-212ENST00000488380 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 C22orf23Q9BZE7 217 aa16.95■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 ZFYVE9O95405 1425 aa16.95■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.95■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.95■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 NSD2O96028 1365 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 TSPOAP1O95153 1857 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 HSCBQ8IWL3 235 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 DDX11L8A8MPP1 907 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 MLECQ14165 292 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 CDK19Q9BWU1 502 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 CABP1Q9NZU7 370 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 CCDC27Q2M243 656 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 ALKQ9UM73 1620 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 ADGRB2O60241 1585 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 NLRP1Q9C000 1473 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.91■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 TPM2P07951 284 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 RBM10P98175 930 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
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NISCH-212ENST00000488380 TMPOP42166 694 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.9■□□□□ 0.3
NISCH-212ENST00000488380 NINLQ9Y2I6 1382 aa16.89■□□□□ 0.3
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NISCH-212ENST00000488380 GAS2L3Q86XJ1 694 aa16.89■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.88■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 ARID3AQ99856 593 aa16.88■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.87■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 PODXL2Q9NZ53 605 aa16.86■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 RIPK4P57078 832 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 FAM13BQ9NYF5 915 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 SMC4Q9NTJ3 1288 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 SSH1Q8WYL5 1049 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 GBP4Q96PP9 640 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 MVPQ14764 893 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.83■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 DIP2BQ9P265 1576 aa16.83■□□□□ 0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 TRIM27P14373 513 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.81■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 HMOX1P09601 288 aa16.81■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 NASPP49321 788 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 POLKQ9UBT6 870 aa16.81■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.8■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 PRKAR2BP31323 418 aa16.8■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
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