RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487163.5

USP21-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP21, Length 2,514 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-208ENST00000487163 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.71■■□□□ 1.07
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USP21-208ENST00000487163 C8orf34Q49A92 452 aa21.7■■□□□ 1.06
USP21-208ENST00000487163 FAM161AQ3B820 660 aa21.69■■□□□ 1.06
USP21-208ENST00000487163 MED14O60244 1454 aa21.68■■□□□ 1.06
USP21-208ENST00000487163 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP21-208ENST00000487163 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.68■■□□□ 1.06
USP21-208ENST00000487163 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
USP21-208ENST00000487163 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.68■■□□□ 1.06
USP21-208ENST00000487163 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
USP21-208ENST00000487163 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.66■■□□□ 1.06
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USP21-208ENST00000487163 METP08581 1390 aa21.65■■□□□ 1.06
USP21-208ENST00000487163 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.65■■□□□ 1.06
USP21-208ENST00000487163 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
USP21-208ENST00000487163 DLC1Q96QB1 1528 aa21.64■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 ZMYM3Q14202 1370 aa21.64■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 RIPK4P57078 832 aa21.63■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.63■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.63■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.63■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.62■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 POLKQ9UBT6 870 aa21.62■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.61■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 ATP7BP35670 1465 aa21.6■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.59■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.59■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.58■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 SLC4A3P48751 1232 aa21.58■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 NME9Q86XW9 330 aa21.58■■□□□ 1.05
USP21-208ENST00000487163 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.58■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 PRKAR2BP31323 418 aa21.57■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.57■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.57■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.57■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.56■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 HMOX1P09601 288 aa21.56■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.56■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.56■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 FCHSD2O94868 740 aa21.55■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.55■■□□□ 1.04
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USP21-208ENST00000487163 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 TRIM27P14373 513 aa21.54■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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USP21-208ENST00000487163 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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USP21-208ENST00000487163 IL16Q14005 1332 aa21.52■■□□□ 1.04
USP21-208ENST00000487163 TNRQ92752 1358 aa21.52■■□□□ 1.04
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USP21-208ENST00000487163 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.51■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.51■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.51■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.5■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 SEC24BO95487 1268 aa21.49■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 CPS1P31327 1500 aa21.49■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 NEFMP07197 916 aa21.49■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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USP21-208ENST00000487163 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.48■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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USP21-208ENST00000487163 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.48■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 NUTM2FA1L443 756 aa21.47■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 IL13P35225 146 aa21.47■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 COG3Q96JB2 828 aa21.47■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.46■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.46■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.46■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 TECPR2O15040 1411 aa21.46■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
USP21-208ENST00000487163 BCL11AQ9H165 835 aa21.45■■□□□ 1.02
USP21-208ENST00000487163 USP19O94966 1318 aa21.45■■□□□ 1.02
USP21-208ENST00000487163 NFE2L2Q16236 605 aa21.45■■□□□ 1.02
USP21-208ENST00000487163 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.45■■□□□ 1.02
USP21-208ENST00000487163 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.44■■□□□ 1.02
USP21-208ENST00000487163 LTKP29376 864 aa21.44■■□□□ 1.02
USP21-208ENST00000487163 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.43■■□□□ 1.02
USP21-208ENST00000487163 SIRT1Q96EB6 747 aa21.43■■□□□ 1.02
USP21-208ENST00000487163 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
USP21-208ENST00000487163 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.42■■□□□ 1.02
USP21-208ENST00000487163 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.41■■□□□ 1.02
USP21-208ENST00000487163 ITSN1Q15811 1721 aa21.4■■□□□ 1.02
USP21-208ENST00000487163 KIF16BQ96L93 1317 aa21.4■■□□□ 1.02
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