RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEP170Q5SW79 1584 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 G3V3G9 751 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC4A2P04920 1241 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCC2Q92887 1545 aa20.17■□□□□ 0.82
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.16■□□□□ 0.82
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.14■□□□□ 0.81
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.13■□□□□ 0.81
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WWC1Q8IX03 1113 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.12■□□□□ 0.81
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDE4CQ08493 712 aa20.11■□□□□ 0.81
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.1■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATF3P18847 181 aa20.1■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.07■□□□□ 0.8
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VPS37DQ86XT2 251 aa20.05■□□□□ 0.8
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.05■□□□□ 0.8
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL27Q8NEV9 243 aa20.04■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.04■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADGRL2O95490 1459 aa20.04■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCTN1Q14203 1278 aa20.04■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPM3P06753 285 aa20.03■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.03■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.03■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNTROBQ8N137 903 aa20.03■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.02■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.02■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIL1Q9H173 461 aa20.02■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.02■□□□□ 0.8
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