RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 ALKQ9UM73 1620 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 RIPK4P57078 832 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 SEC24BO95487 1268 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 NLRP1Q9C000 1473 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 MLECQ14165 292 aa21.64■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 FBLN1P23142 703 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 MED14O60244 1454 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 NFKBIBQ15653 356 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 USP19O94966 1318 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 TSPOAP1O95153 1857 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 TRIM27P14373 513 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 IL16Q14005 1332 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-207ENST00000462494 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.58■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 FCHSD2O94868 740 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 PRKAR2BP31323 418 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 POLKQ9UBT6 870 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 HMOX1P09601 288 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 DIP2BQ9P265 1576 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-207ENST00000462494 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.52■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 ATP7BP35670 1465 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 DLC1Q96QB1 1528 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 BECN1Q14457 450 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 AGLP35573 1532 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 KIF16BQ96L93 1317 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 NME9Q86XW9 330 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 ZMYM3Q14202 1370 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 REREQ9P2R6 1566 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 GSE1Q14687 1217 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 METP08581 1390 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 NFE2L2Q16236 605 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.45■■□□□ 1.03
ACTB-207ENST00000462494 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.023e-11■■■■□ 24.1
ACTB-207ENST00000462494 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 IL13P35225 146 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 COG3Q96JB2 828 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 SMC5Q8IY18 1101 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 TSPYL6Q8N831 410 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-207ENST00000462494 VAMP4O75379 141 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-207ENST00000462494 GNAI1P63096 354 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-207ENST00000462494 ZNF428Q96B54 188 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-207ENST00000462494 MBIPQ9NS73 344 aa21.38■■□□□ 1.01
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