RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
IMP4-208ENST00000460766 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.22■■□□□ 1.79
IMP4-208ENST00000460766 MED14O60244 1454 aa26.21■■□□□ 1.79
IMP4-208ENST00000460766 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
IMP4-208ENST00000460766 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.21■■□□□ 1.79
IMP4-208ENST00000460766 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
IMP4-208ENST00000460766 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.2■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.19■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 RIPK4P57078 832 aa26.18■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.18■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 SEC24BO95487 1268 aa26.15■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.15■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 MLECQ14165 292 aa26.14■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.14■■□□□ 1.78
IMP4-208ENST00000460766 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.13■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.13■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 USP19O94966 1318 aa26.13■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 IL16Q14005 1332 aa26.12■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 FBLN1P23142 703 aa26.12■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.12■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 TRIM27P14373 513 aa26.12■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 NFKBIBQ15653 356 aa26.12■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.12■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.11■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.1■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 FCHSD2O94868 740 aa26.09■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.09■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 DIP2BQ9P265 1576 aa26.08■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 POLKQ9UBT6 870 aa26.08■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
IMP4-208ENST00000460766 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 PRKAR2BP31323 418 aa26.07■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 AGLP35573 1532 aa26.07■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 TSPOAP1O95153 1857 aa26.06■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 DLC1Q96QB1 1528 aa26.06■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.06■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 ATP7BP35670 1465 aa26.05■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.05■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 REREQ9P2R6 1566 aa26.04■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.04■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.04■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 ZMYM3Q14202 1370 aa26.03■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.03■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 HMOX1P09601 288 aa26.02■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 KIF16BQ96L93 1317 aa26.02■■□□□ 1.76
IMP4-208ENST00000460766 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.01■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.99■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.99■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 NME9Q86XW9 330 aa25.99■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.98■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 BECN1Q14457 450 aa25.98■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.98■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 METP08581 1390 aa25.98■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.97■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.97■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.97■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 NFE2L2Q16236 605 aa25.96■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.96■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.96■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
IMP4-208ENST00000460766 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.95■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.95■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.94■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 GSE1Q14687 1217 aa25.93■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 IL13P35225 146 aa25.92■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 COG3Q96JB2 828 aa25.91■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.9■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.9■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 SMC5Q8IY18 1101 aa25.89■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 ZNF428Q96B54 188 aa25.89■■□□□ 1.74
IMP4-208ENST00000460766 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.87■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 VAMP4O75379 141 aa25.87■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 GNAI1P63096 354 aa25.87■■□□□ 1.73
IMP4-208ENST00000460766 TSPYL6Q8N831 410 aa25.87■■□□□ 1.73
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