RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 DEPDC5O75140 1603 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCA6Q8N139 1617 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 LAMC1P11047 1609 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 TSPYL6Q8N831 410 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 MYOM1P52179 1685 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 FYB1O15117 783 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 MROH2AA6NES4 1674 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 CEP152O94986 1710 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM83GA6ND36 823 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PP64 1363 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRJ-202ENST00000440289 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 NLRP1Q9C000 1473 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 CDK19Q9BWU1 502 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC27Q2M243 656 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 SSFA2P28290 1259 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 KRT24Q2M2I5 525 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 KIF16BQ96L93 1317 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 ARID3AQ99856 593 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRJ-202ENST00000440289 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 SMC5Q8IY18 1101 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 NUCB1Q02818 461 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 PLEKHG5O94827 1062 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 GBP4Q96PP9 640 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 KIF1BO60333 1816 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 AAMPQ13685 434 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 MRE11P49959 708 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 MCTP1Q6DN14 999 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 NME9Q86XW9 330 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 NECTIN2Q92692 538 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-202ENST00000440289 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 MBIPQ9NS73 344 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 MYOM2P54296 1465 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCC3O15438 1527 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 POLKQ9UBT6 870 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 VAMP4O75379 141 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 ESPNB1AK53 854 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 PKP1Q13835 747 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 ERBB4Q15303 1308 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 MPNDQ8N594 471 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 FSD2A1L4K1 749 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRJ-202ENST00000440289 MCM10Q7L590 875 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRJ-202ENST00000440289 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRJ-202ENST00000440289 ADGRB3O60242 1522 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRJ-202ENST00000440289 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRJ-202ENST00000440289 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms