RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.56□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.56□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TULP4Q9NRJ4 1543 aa11.55□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PNPLA6Q8IY17 1366 aa11.55□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC24A1O60721 1099 aa11.55□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLEKHG5O94827 1062 aa11.55□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CREBZFQ9NS37 354 aa11.55□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PXDNQ92626 1479 aa11.54□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.54□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRR36Q9H6K5 1346 aa11.54□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SBNO1A3KN83 1393 aa11.54□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.53□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.53□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.53□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FBXO3Q9UK99 471 aa11.53□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EVC2Q86UK5 1308 aa11.53□□□□□ -0.56
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 USP32Q8NFA0 1604 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARHGEF10O15013 1369 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATP7BP35670 1465 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LRP6O75581 1613 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ILDR2Q71H61 639 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CABP2Q9NPB3 220 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ITSN1Q15811 1721 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ACEP12821 1306 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 QRICH2Q9H0J4 1663 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADAMTS2O95450 1211 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NGLY1Q96IV0 654 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POTEAQ6S8J7 498 aa11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C8orf37Q96NL8 207 aa11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CABP1Q9NZU7 370 aa11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AFF2P51816 1311 aa11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SOCS7O14512 581 aa11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MIER1Q8N108 512 aa11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RXRBP28702 533 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TESK2Q96S53 571 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 USP21Q9UK80 565 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ABTB2Q8N961 1025 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALS2Q96Q42 1657 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMF1P82094 1093 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDCA8Q53HL2 280 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NLRP13Q86W25 1043 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CABLES1Q8TDN4 633 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 USP47Q96K76 1375 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UNC5CLQ8IV45 518 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 USP6P35125 1406 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NINLQ9Y2I6 1382 aa11.4□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TTC21AQ8NDW8 1320 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SSH2Q76I76 1423 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TERF2IPQ9NYB0 399 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM83GA6ND36 823 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CLCN6P51797 869 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMC1Q8TDI8 760 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLIT2O94813 1529 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NLRP6P59044 892 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 USP19O94966 1318 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATRNO75882 1429 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms