RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428818.5

TTC28-AS1-208, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene TTC28-AS1, Length 706 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CHADLQ6NUI6 762 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ANKARQ7Z5J8 1434 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MYOM1P52179 1685 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PRR29P0C7W0 189 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NRKQ7Z2Y5 1582 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CARD11Q9BXL7 1154 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MON2Q7Z3U7 1717 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 WASLO00401 505 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ESCO1Q5FWF5 840 aa13.44□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 USP47Q96K76 1375 aa13.44□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PNPLA6Q8IY17 1366 aa13.42□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PIK3C2AO00443 1686 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CDK19Q9BWU1 502 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CABP2Q9NPB3 220 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 JCADQ9P266 1359 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DISP3Q9P2K9 1392 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FOXO3O43524 673 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PLCH1Q4KWH8 1693 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TNS3Q68CZ2 1445 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TESK2Q96S53 571 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NPHP3Q7Z494 1330 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CD163L1Q9NR16 1453 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FBXO3Q9UK99 471 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KIF20BQ96Q89 1820 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C19orf67A6NJJ6 358 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 EVC2Q86UK5 1308 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 USP54Q70EL1 1684 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NRAPQ86VF7 1730 aa13.33□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PLEKHG5O94827 1062 aa13.33□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KRT28Q7Z3Y7 464 aa13.32□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ACEP12821 1306 aa13.32□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa13.32□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 USP6P35125 1406 aa13.31□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RGPD5Q99666 1765 aa13.31□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SBNO1A3KN83 1393 aa13.31□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ATAD2Q6PL18 1390 aa13.3□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LTN1O94822 1766 aa13.3□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CABP1Q9NZU7 370 aa13.29□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CCDC61Q9Y6R9 512 aa13.29□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SSH2Q76I76 1423 aa13.29□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NWD2Q9ULI1 1742 aa13.28□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PLEKHG3A1L390 1219 aa13.28□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CABLES1Q8TDN4 633 aa13.28□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa13.28□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 A0A1W2PP64 1363 aa13.28□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PSME1Q06323 249 aa13.27□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NUTM2GQ5VZR2 741 aa13.27□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SLIT3O75094 1523 aa13.27□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa13.27□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LMOD2Q6P5Q4 547 aa13.26□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LMO7Q8WWI1 1683 aa13.26□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ARHGEF10O15013 1369 aa13.25□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ADAMTS2O95450 1211 aa13.25□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.25□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 COL18A1P39060 1754 aa13.25□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NFAT5O94916 1531 aa13.24□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 WNK3Q9BYP7 1800 aa13.23□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TMC1Q8TDI8 760 aa13.23□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP13.22□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ILDR2Q71H61 639 aa13.22□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C8orf37Q96NL8 207 aa13.22□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.22□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GLI3P10071 1580 aa13.22□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 BRWD3Q6RI45 1802 aa13.22□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 USP19O94966 1318 aa13.21□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 AFF2P51816 1311 aa13.21□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TMF1P82094 1093 aa13.21□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SLIT2O94813 1529 aa13.21□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms