RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-202ENST00000420808 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-202ENST00000420808 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-202ENST00000420808 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.03■□□□□ 0.8
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NISCH-202ENST00000420808 MED14O60244 1454 aa19.93■□□□□ 0.78
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NISCH-202ENST00000420808 IL13P35225 146 aa19.83■□□□□ 0.77
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NISCH-202ENST00000420808 TBC1D32Q96NH3 1257 aa19.79■□□□□ 0.76
NISCH-202ENST00000420808 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
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NISCH-202ENST00000420808 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
NISCH-202ENST00000420808 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-202ENST00000420808 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.77■□□□□ 0.76
NISCH-202ENST00000420808 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.76■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 KIF16BQ96L93 1317 aa19.76■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.76■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.76■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 LNPKQ9C0E8 428 aa19.76■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
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