RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC173Q0VFZ6 552 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 ESPNB1AK53 854 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 GNAI1P63096 354 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 MNS1Q8NEH6 495 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC191Q8NCU4 936 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 WWC1Q8IX03 1113 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 GRPEL1Q9HAV7 217 aa10.69□□□□□ -0.7
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PTPRM-202ENST00000400053 HSP90B2PQ58FF3 399 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 UGGT2Q9NYU1 1516 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 BCAR3O75815 825 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 CPLX1O14810 134 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
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PTPRM-202ENST00000400053 NEK4P51957 841 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 MCM4P33991 863 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 TRDNQ13061 729 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC27Q2M243 656 aa10.66□□□□□ -0.7
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PTPRM-202ENST00000400053 MBD3O95983 291 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
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PTPRM-202ENST00000400053 KIF14Q15058 1648 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa10.65□□□□□ -0.7
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PTPRM-202ENST00000400053 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 SLC52A1Q9NWF4 448 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
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PTPRM-202ENST00000400053 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 FAM69CQ0P6D2 419 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 TSPY26PQ9H489 355 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.717e-8■■■■■ 186.3
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PTPRM-202ENST00000400053 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
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PTPRM-202ENST00000400053 C1orf141Q5JVX7 400 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 PRAM1Q96QH2 718 aa10.62□□□□□ -0.71
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PTPRM-202ENST00000400053 TEFQ10587 303 aa10.61□□□□□ -0.71
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PTPRM-202ENST00000400053 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa10.6□□□□□ -0.71
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PTPRM-202ENST00000400053 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
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PTPRM-202ENST00000400053 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 TTC5Q8N0Z6 440 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRM-202ENST00000400053 TTLL5Q6EMB2 1281 aa10.59□□□□□ -0.71
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PTPRM-202ENST00000400053 BRMS1Q9HCU9 246 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRM-202ENST00000400053 H0YHG0 523 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRM-202ENST00000400053 TSPYL4Q9UJ04 414 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRM-202ENST00000400053 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRM-202ENST00000400053 ZSCAN30Q86W11 494 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRM-202ENST00000400053 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRM-202ENST00000400053 SKIDA1Q1XH10 827 aa10.58□□□□□ -0.72
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