RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394106.6

CMTM4-202, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-202ENST00000394106 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
CMTM4-202ENST00000394106 BCL9LQ86UU0 1499 aa43.62■■■■■ 4.57
CMTM4-202ENST00000394106 CABP1Q9NZU7 370 aa43.61■■■■■ 4.57
CMTM4-202ENST00000394106 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
CMTM4-202ENST00000394106 ATRNO75882 1429 aa43.59■■■■■ 4.57
CMTM4-202ENST00000394106 CLSPNQ9HAW4 1339 aa43.59■■■■■ 4.57
CMTM4-202ENST00000394106 SLIT2O94813 1529 aa43.57■■■■■ 4.56
CMTM4-202ENST00000394106 NUTM2GQ5VZR2 741 aa43.55■■■■■ 4.56
CMTM4-202ENST00000394106 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa43.54■■■■■ 4.56
CMTM4-202ENST00000394106 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa43.54■■■■■ 4.56
CMTM4-202ENST00000394106 PLCH1Q4KWH8 1693 aa43.53■■■■■ 4.56
CMTM4-202ENST00000394106 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
CMTM4-202ENST00000394106 RGS12O14924 1447 aa43.52■■■■■ 4.56
CMTM4-202ENST00000394106 UNC5CLQ8IV45 518 aa43.52■■■■■ 4.56
CMTM4-202ENST00000394106 FAM83GA6ND36 823 aa43.49■■■■■ 4.55
CMTM4-202ENST00000394106 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
CMTM4-202ENST00000394106 ABTB2Q8N961 1025 aa43.48■■■■■ 4.55
CMTM4-202ENST00000394106 ATAD2Q6PL18 1390 aa43.47■■■■■ 4.55
CMTM4-202ENST00000394106 NWD2Q9ULI1 1742 aa43.46■■■■■ 4.55
CMTM4-202ENST00000394106 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
CMTM4-202ENST00000394106 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa43.45■■■■■ 4.55
CMTM4-202ENST00000394106 USP6P35125 1406 aa43.45■■■■■ 4.55
CMTM4-202ENST00000394106 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP43.43■■■■■ 4.54
CMTM4-202ENST00000394106 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
CMTM4-202ENST00000394106 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
CMTM4-202ENST00000394106 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa43.4■■■■■ 4.54
CMTM4-202ENST00000394106 PRDM11Q9NQV5 511 aa43.38■■■■■ 4.53
CMTM4-202ENST00000394106 AKAP12Q02952 1782 aa43.37■■■■■ 4.53
CMTM4-202ENST00000394106 BTG4Q9NY30 223 aa43.36■■■■■ 4.53
CMTM4-202ENST00000394106 KIAA0232Q92628 1395 aa43.35■■■■■ 4.53
CMTM4-202ENST00000394106 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
CMTM4-202ENST00000394106 GLI3P10071 1580 aa43.34■■■■■ 4.53
CMTM4-202ENST00000394106 VPS72Q15906 364 aa43.34■■■■■ 4.53
CMTM4-202ENST00000394106 NLRP13Q86W25 1043 aa43.34■■■■■ 4.53
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
CMTM4-202ENST00000394106 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
CMTM4-202ENST00000394106 NRAPQ86VF7 1730 aa43.33■■■■■ 4.53
CMTM4-202ENST00000394106 USP47Q96K76 1375 aa43.32■■■■■ 4.53
CMTM4-202ENST00000394106 TESK2Q96S53 571 aa43.32■■■■■ 4.53
CMTM4-202ENST00000394106 NRKQ7Z2Y5 1582 aa43.32■■■■■ 4.52
CMTM4-202ENST00000394106 SSH2Q76I76 1423 aa43.31■■■■■ 4.52
CMTM4-202ENST00000394106 USP19O94966 1318 aa43.31■■■■■ 4.52
CMTM4-202ENST00000394106 TMC1Q8TDI8 760 aa43.31■■■■■ 4.52
CMTM4-202ENST00000394106 CHRNA2Q15822 529 aa43.29■■■■■ 4.52
CMTM4-202ENST00000394106 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
CMTM4-202ENST00000394106 NLRP6P59044 892 aa43.28■■■■■ 4.52
CMTM4-202ENST00000394106 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
CMTM4-202ENST00000394106 PIK3C2AO00443 1686 aa43.27■■■■■ 4.52
CMTM4-202ENST00000394106 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa43.25■■■■■ 4.51
CMTM4-202ENST00000394106 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP43.25■■■■■ 4.518e-7■□□□□ 10.2
CMTM4-202ENST00000394106 MON2Q7Z3U7 1717 aa43.23■■■■■ 4.51
CMTM4-202ENST00000394106 GCP02774 474 aa43.23■■■■■ 4.51
CMTM4-202ENST00000394106 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa43.22■■■■■ 4.51
CMTM4-202ENST00000394106 SLC24A1O60721 1099 aa43.21■■■■■ 4.51
CMTM4-202ENST00000394106 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
CMTM4-202ENST00000394106 CD163L1Q9NR16 1453 aa43.19■■■■■ 4.51
CMTM4-202ENST00000394106 TTC21AQ8NDW8 1320 aa43.19■■■■■ 4.5
CMTM4-202ENST00000394106 CPDO75976 1380 aa43.17■■■■■ 4.5
CMTM4-202ENST00000394106 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
CMTM4-202ENST00000394106 SLIT3O75094 1523 aa43.16■■■■■ 4.5
CMTM4-202ENST00000394106 STRN4Q9NRL3 753 aa43.15■■■■■ 4.5
CMTM4-202ENST00000394106 ZBTB7CA1YPR0 619 aa43.14■■■■■ 4.5
CMTM4-202ENST00000394106 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP43.14■■■■■ 4.5
CMTM4-202ENST00000394106 TMF1P82094 1093 aa43.13■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 SEPT12Q8IYM1 358 aa43.13■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 TERF2IPQ9NYB0 399 aa43.13■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa43.1■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa43.1■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 BRWD3Q6RI45 1802 aa43.09■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 A0A1W2PP64 1363 aa43.09■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 A0A0G2JS52 829 aa43.09■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 MYT1Q01538 1121 aa43.09■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 LMO7Q8WWI1 1683 aa43.08■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 EVA1CP58658 441 aa43.08■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa43.08■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 NINLQ9Y2I6 1382 aa43.07■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.49
CMTM4-202ENST00000394106 SOX12O15370 315 aa43.06■■■■■ 4.48
CMTM4-202ENST00000394106 ZRANB1Q9UGI0 708 aa43.04■■■■■ 4.48
CMTM4-202ENST00000394106 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
CMTM4-202ENST00000394106 NME9Q86XW9 330 aa43.03■■■■■ 4.48
CMTM4-202ENST00000394106 KCNH5Q8NCM2 988 aa43.02■■■■■ 4.48
CMTM4-202ENST00000394106 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa43■■■■■ 4.47
CMTM4-202ENST00000394106 USP35Q9P2H5 1018 aa42.98■■■■■ 4.47
CMTM4-202ENST00000394106 CDCA8Q53HL2 280 aa42.97■■■■■ 4.47
CMTM4-202ENST00000394106 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
CMTM4-202ENST00000394106 AATKQ6ZMQ8 1374 aa42.97■■■■■ 4.47
CMTM4-202ENST00000394106 USP31Q70CQ4 1352 aa42.97■■■■■ 4.47
CMTM4-202ENST00000394106 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
CMTM4-202ENST00000394106 NFAT5O94916 1531 aa42.94■■■■■ 4.46
CMTM4-202ENST00000394106 KRT27Q7Z3Y8 459 aa42.94■■■■■ 4.46
CMTM4-202ENST00000394106 USP54Q70EL1 1684 aa42.94■■■■■ 4.46
CMTM4-202ENST00000394106 ARHGEF25Q86VW2 580 aa42.92■■■■■ 4.46
CMTM4-202ENST00000394106 COL18A1P39060 1754 aa42.92■■■■■ 4.46
CMTM4-202ENST00000394106 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa42.91■■■■■ 4.46
CMTM4-202ENST00000394106 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa42.91■■■■■ 4.46
CMTM4-202ENST00000394106 AXIN2Q9Y2T1 843 aa42.87■■■■■ 4.45
CMTM4-202ENST00000394106 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP42.86■■■■■ 4.45
CMTM4-202ENST00000394106 TCP11L2Q8N4U5 519 aa42.84■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.3 ms