RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 ORAI2Q96SN7 254 aa24.07■■□□□ 1.44
LTV1-201ENST00000367576 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.07■■□□□ 1.44
LTV1-201ENST00000367576 NLRP13Q86W25 1043 aa24.07■■□□□ 1.44
LTV1-201ENST00000367576 MST1RQ04912 1400 aa24.07■■□□□ 1.44
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.06■■□□□ 1.44
LTV1-201ENST00000367576 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.05■■□□□ 1.44
LTV1-201ENST00000367576 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
LTV1-201ENST00000367576 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.04■■□□□ 1.44
LTV1-201ENST00000367576 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.03■■□□□ 1.44
LTV1-201ENST00000367576 FAM9BQ8IZU0 186 aa24■■□□□ 1.43
LTV1-201ENST00000367576 SSH2Q76I76 1423 aa24■■□□□ 1.43
LTV1-201ENST00000367576 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.99■■□□□ 1.43
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LTV1-201ENST00000367576 KIF1AQ12756 1690 aa23.98■■□□□ 1.43
LTV1-201ENST00000367576 FOXO3O43524 673 aa23.97■■□□□ 1.43
LTV1-201ENST00000367576 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
LTV1-201ENST00000367576 PSME1Q06323 249 aa23.96■■□□□ 1.43
LTV1-201ENST00000367576 COG3Q96JB2 828 aa23.96■■□□□ 1.43
LTV1-201ENST00000367576 PIK3C2AO00443 1686 aa23.95■■□□□ 1.42
LTV1-201ENST00000367576 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.95■■□□□ 1.42
LTV1-201ENST00000367576 FBLN1P23142 703 aa23.94■■□□□ 1.42
LTV1-201ENST00000367576 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.94■■□□□ 1.42
LTV1-201ENST00000367576 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
LTV1-201ENST00000367576 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.92■■□□□ 1.42
LTV1-201ENST00000367576 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.92■■□□□ 1.42
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LTV1-201ENST00000367576 MTHFSP49914 203 aa23.91■■□□□ 1.42
LTV1-201ENST00000367576 SLAIN2Q9P270 581 aa23.9■■□□□ 1.42
LTV1-201ENST00000367576 SOX12O15370 315 aa23.89■■□□□ 1.42
LTV1-201ENST00000367576 BRINP3Q76B58 766 aa23.89■■□□□ 1.41
LTV1-201ENST00000367576 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.89■■□□□ 1.41
LTV1-201ENST00000367576 ABTB2Q8N961 1025 aa23.88■■□□□ 1.41
LTV1-201ENST00000367576 NLRP6P59044 892 aa23.87■■□□□ 1.41
LTV1-201ENST00000367576 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
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LTV1-201ENST00000367576 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
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LTV1-201ENST00000367576 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.85■■□□□ 1.41
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LTV1-201ENST00000367576 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.83■■□□□ 1.41
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LTV1-201ENST00000367576 POLKQ9UBT6 870 aa23.83■■□□□ 1.41
LTV1-201ENST00000367576 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.82■■□□□ 1.4
LTV1-201ENST00000367576 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 28.4
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LTV1-201ENST00000367576 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.81■■□□□ 1.4
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LTV1-201ENST00000367576 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.74■■□□□ 1.39
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LTV1-201ENST00000367576 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.72■■□□□ 1.39
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LTV1-201ENST00000367576 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
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LTV1-201ENST00000367576 NUDCQ9Y266 331 aa23.68■■□□□ 1.38
LTV1-201ENST00000367576 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.67■■□□□ 1.38
LTV1-201ENST00000367576 GCP02774 474 aa23.66■■□□□ 1.38
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LTV1-201ENST00000367576 LTN1O94822 1766 aa23.66■■□□□ 1.38
LTV1-201ENST00000367576 ARHGEF10O15013 1369 aa23.66■■□□□ 1.38
LTV1-201ENST00000367576 FLT4P35916 1363 aa23.66■■□□□ 1.38
LTV1-201ENST00000367576 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.66■■□□□ 1.38
LTV1-201ENST00000367576 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
LTV1-201ENST00000367576 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
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LTV1-201ENST00000367576 TOM1O60784 492 aa23.63■■□□□ 1.37
LTV1-201ENST00000367576 IL13P35225 146 aa23.63■■□□□ 1.37
LTV1-201ENST00000367576 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
LTV1-201ENST00000367576 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
LTV1-201ENST00000367576 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.62■■□□□ 1.37
LTV1-201ENST00000367576 HOXC9P31274 260 aa23.61■■□□□ 1.37
LTV1-201ENST00000367576 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
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