RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 CFAP53Q96M91 514 aa23.43■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.43■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.43■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 ACEP12821 1306 aa23.42■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF521Q96K83 1311 aa23.42■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 POLKQ9UBT6 870 aa23.42■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 TBX22Q9Y458 520 aa23.42■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 HMOX1P09601 288 aa23.41■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 PDE3BQ13370 1112 aa23.4■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.4■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 CPS1P31327 1500 aa23.4■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 WWC1Q8IX03 1113 aa23.4■■□□□ 1.34
PDE4D-204ENST00000358923 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.39■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.38■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 TECPR2O15040 1411 aa23.38■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.38■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 MED14O60244 1454 aa23.38■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.38■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.38■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 SLFN5Q08AF3 891 aa23.37■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 ATP7BP35670 1465 aa23.37■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 SHPRHQ149N8 1683 aa23.37■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 RUNDC1Q96C34 613 aa23.37■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 SLIT1O75093 1534 aa23.36■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 BCAR3O75815 825 aa23.35■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 NSD2O96028 1365 aa23.35■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 SIRT1Q96EB6 747 aa23.33■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 COG3Q96JB2 828 aa23.33■■□□□ 1.33
PDE4D-204ENST00000358923 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 HSPA2P54652 639 aa23.32■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.32■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.32■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 USP32Q8NFA0 1604 aa23.32■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 SKAP1Q86WV1 359 aa23.31■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 C14orf37Q86TY3 774 aa23.3■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.3■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.29■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 CRBNQ96SW2 442 aa23.29■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.28■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 INSRP06213 1382 aa23.27■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 PRKAR2BP31323 418 aa23.27■■□□□ 1.32
PDE4D-204ENST00000358923 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.25■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.25■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.24■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.24■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.23■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 RIPK4P57078 832 aa23.23■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 TNNQ9UQP3 1299 aa23.23■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.23■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 E9PSI1 815 aa23.22■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.22■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.22■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.22■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PDE4D-204ENST00000358923 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.19■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.19■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 IL13P35225 146 aa23.19■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 USP6P35125 1406 aa23.19■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 NLRP6P59044 892 aa23.19■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 ORAI2Q96SN7 254 aa23.19■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.18■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 DCTN1Q14203 1278 aa23.18■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.18■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 DIP2AQ14689 1571 aa23.18■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 FAM83GA6ND36 823 aa23.18■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.18■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 PTCH1Q13635 1447 aa23.16■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.15■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 ABTB2Q8N961 1025 aa23.15■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 FOXO3O43524 673 aa23.14■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 PANK1Q8TE04 598 aa23.14■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.14■■□□□ 1.3
PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.14■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.13■■□□□ 1.29
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