RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 NME9Q86XW9 330 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCC11Q96J66 1382 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SOX12O15370 315 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM161AQ3B820 660 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 CFAP53Q96M91 514 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 C8orf34Q49A92 452 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR63Q8IWG1 891 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC27Q2M243 656 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 EID1Q9Y6B2 187 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.2■■□□□ 1.47
SH3BP1-201ENST00000357436 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 USP35Q9P2H5 1018 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 IGHDP01880 384 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PANK1Q8TE04 598 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 RGS3P49796 1198 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPRUQ92729 1446 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 COG6Q9Y2V7 657 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 ADGRB2O60241 1585 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1-201ENST00000357436 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 C3P01024 1663 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 HMOX1P09601 288 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 NLRP1Q9C000 1473 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 NEFMP07197 916 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 POLKQ9UBT6 870 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 AAMPQ13685 434 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHG5O94827 1062 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNA6P17658 529 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 DLC1Q96QB1 1528 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP1-201ENST00000357436 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
SH3BP1-201ENST00000357436 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP1-201ENST00000357436 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP1-201ENST00000357436 MED14O60244 1454 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ACEP12821 1306 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP1-201ENST00000357436 RLBP1P12271 317 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP1-201ENST00000357436 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CPS1P31327 1500 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TNNQ9UQP3 1299 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1-201ENST00000357436 COG3Q96JB2 828 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP1-201ENST00000357436 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKAR2BP31323 418 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC4A3P48751 1232 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP7BP35670 1465 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TECPR2O15040 1411 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TBX22Q9Y458 520 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 RIPK4P57078 832 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 USP19O94966 1318 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SIRT1Q96EB6 747 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 IL16Q14005 1332 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 NFKBIBQ15653 356 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 C14orf37Q86TY3 774 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.91■■□□□ 1.42
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