RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.99■■□□□ 1.59
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TM7SF3-201ENST00000343028 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.98■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC27Q2M243 656 aa24.98■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.98■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.97■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.97■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM161AQ3B820 660 aa24.97■■□□□ 1.59
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TM7SF3-201ENST00000343028 NLRP1Q9C000 1473 aa24.95■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.95■■□□□ 1.59
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TM7SF3-201ENST00000343028 METP08581 1390 aa24.94■■□□□ 1.58
TM7SF3-201ENST00000343028 NUTM2FA1L443 756 aa24.92■■□□□ 1.58
TM7SF3-201ENST00000343028 NME9Q86XW9 330 aa24.92■■□□□ 1.58
TM7SF3-201ENST00000343028 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.92■■□□□ 1.58
TM7SF3-201ENST00000343028 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TM7SF3-201ENST00000343028 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.92■■□□□ 1.58
TM7SF3-201ENST00000343028 POLKQ9UBT6 870 aa24.91■■□□□ 1.58
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TM7SF3-201ENST00000343028 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
TM7SF3-201ENST00000343028 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.88■■□□□ 1.57
TM7SF3-201ENST00000343028 AGLP35573 1532 aa24.88■■□□□ 1.57
TM7SF3-201ENST00000343028 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TM7SF3-201ENST00000343028 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.87■■□□□ 1.57
TM7SF3-201ENST00000343028 ADGRB2O60241 1585 aa24.87■■□□□ 1.57
TM7SF3-201ENST00000343028 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.87■■□□□ 1.57
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TM7SF3-201ENST00000343028 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TM7SF3-201ENST00000343028 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.85■■□□□ 1.57
TM7SF3-201ENST00000343028 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.85■■□□□ 1.57
TM7SF3-201ENST00000343028 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.85■■□□□ 1.57
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TM7SF3-201ENST00000343028 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TM7SF3-201ENST00000343028 SEC24BO95487 1268 aa24.83■■□□□ 1.57
TM7SF3-201ENST00000343028 TRIM27P14373 513 aa24.83■■□□□ 1.57
TM7SF3-201ENST00000343028 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.83■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
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TM7SF3-201ENST00000343028 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.82■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.82■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.81■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 NEFMP07197 916 aa24.81■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.81■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 REREQ9P2R6 1566 aa24.81■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.8■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 MED14O60244 1454 aa24.8■■□□□ 1.56
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TM7SF3-201ENST00000343028 SOX12O15370 315 aa24.78■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 FCHSD2O94868 740 aa24.78■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.78■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.78■■□□□ 1.56
TM7SF3-201ENST00000343028 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.75■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 ATP7BP35670 1465 aa24.75■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 TNRQ92752 1358 aa24.75■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 DLC1Q96QB1 1528 aa24.75■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.75■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.75■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 COG3Q96JB2 828 aa24.75■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
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TM7SF3-201ENST00000343028 LTKP29376 864 aa24.73■■□□□ 1.55
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TM7SF3-201ENST00000343028 FAM83GA6ND36 823 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 CPS1P31327 1500 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 IL13P35225 146 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 DCTN1Q14203 1278 aa24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-201ENST00000343028 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
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TM7SF3-201ENST00000343028 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.7■■□□□ 1.54
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TM7SF3-201ENST00000343028 NFE2L2Q16236 605 aa24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-201ENST00000343028 IL16Q14005 1332 aa24.69■■□□□ 1.54
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TM7SF3-201ENST00000343028 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.68■■□□□ 1.54
TM7SF3-201ENST00000343028 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.66■■□□□ 1.54
TM7SF3-201ENST00000343028 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.66■■□□□ 1.54
TM7SF3-201ENST00000343028 AAMPQ13685 434 aa24.63■■□□□ 1.53
TM7SF3-201ENST00000343028 MBIPQ9NS73 344 aa24.63■■□□□ 1.53
TM7SF3-201ENST00000343028 ACEP12821 1306 aa24.63■■□□□ 1.53
TM7SF3-201ENST00000343028 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.63■■□□□ 1.53
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF16BQ96L93 1317 aa24.61■■□□□ 1.53
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