RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 BECN1Q14457 450 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 FYB1O15117 783 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 ALKQ9UM73 1620 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 STK26Q9P289 416 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 PRAM1Q96QH2 718 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 DLC1Q96QB1 1528 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM27P14373 513 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 IL27Q8NEV9 243 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 POGKQ9P215 609 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 ATP7BP35670 1465 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 KIF16BQ96L93 1317 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 REREQ9P2R6 1566 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD1-201ENST00000331462 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.64■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 RIPK4P57078 832 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 FCHSD2O94868 740 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 SMC5Q8IY18 1101 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 CDK19Q9BWU1 502 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF428Q96B54 188 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 AGLP35573 1532 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D2Q9BYX2 928 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD1-201ENST00000331462 CABP1Q9NZU7 370 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD1-201ENST00000331462 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.55■■■□□ 2.16
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HOXD1-201ENST00000331462 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD1-201ENST00000331462 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD1-201ENST00000331462 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
HOXD1-201ENST00000331462 POLKQ9UBT6 870 aa28.51■■■□□ 2.16
HOXD1-201ENST00000331462 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.51■■■□□ 2.16
HOXD1-201ENST00000331462 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 PIK3R4Q99570 1358 aa28.5■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 PRKAR2BP31323 418 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 PTCH1Q13635 1447 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 NUCB1Q02818 461 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 NFE2L2Q16236 605 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.45■■■□□ 2.15
HOXD1-201ENST00000331462 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 DIP2BQ9P265 1576 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 IFT57Q9NWB7 429 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF853P0CG23 659 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 VAMP4O75379 141 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 IL13P35225 146 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
HOXD1-201ENST00000331462 GNAI1P63096 354 aa28.39■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.39■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.38■■■□□ 2.13
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