RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.02■■□□□ 1.6
SPNS2-201ENST00000329078 USP19O94966 1318 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 CEP152O94986 1710 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 NME9Q86XW9 330 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 FAM83GA6ND36 823 aa25■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 KIF1BO60333 1816 aa25■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 TSPYL6Q8N831 410 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 MYOM2P54296 1465 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 MYOM1P52179 1685 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SPNS2-201ENST00000329078 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 MROH2AA6NES4 1674 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 HSCBQ8IWL3 235 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.92■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.92■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC27Q2M243 656 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 POLKQ9UBT6 870 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 KRT24Q2M2I5 525 aa24.89■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.89■■□□□ 1.58
SPNS2-201ENST00000329078 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.88■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 COG3Q96JB2 828 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 ARID3AQ99856 593 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 NECTIN2Q92692 538 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 KIF16BQ96L93 1317 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.85■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 C14orf37Q86TY3 774 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 FCHSD2O94868 740 aa24.83■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.83■■□□□ 1.57
SPNS2-201ENST00000329078 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 MCM10Q7L590 875 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 MBIPQ9NS73 344 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 DEPDC5O75140 1603 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 ADGRB3O60242 1522 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 NFE2L2Q16236 605 aa24.8■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.8■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 ABCC11Q96J66 1382 aa24.8■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.79■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.79■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 ABCC3O15438 1527 aa24.78■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.78■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.77■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 TRAK2O60296 914 aa24.77■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 NSD2O96028 1365 aa24.77■■□□□ 1.56
SPNS2-201ENST00000329078 GNAI1P63096 354 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 ADGRB1O14514 1584 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 AAMPQ13685 434 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 MCM4P33991 863 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 GLI2P10070 1586 aa24.75■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 VAMP4O75379 141 aa24.75■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.73■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 SMC5Q8IY18 1101 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 NUCB1Q02818 461 aa24.7■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
SPNS2-201ENST00000329078 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.7■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms