RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 NGLY1Q96IV0 654 aa24.61■■□□□ 1.53
SYNE4-201ENST00000324444 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.61■■□□□ 1.53
SYNE4-201ENST00000324444 CCER2I3L3R5 266 aa24.6■■□□□ 1.53
SYNE4-201ENST00000324444 TMC1Q8TDI8 760 aa24.6■■□□□ 1.53
SYNE4-201ENST00000324444 RXRBP28702 533 aa24.59■■□□□ 1.53
SYNE4-201ENST00000324444 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SYNE4-201ENST00000324444 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.59■■□□□ 1.53
SYNE4-201ENST00000324444 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.58■■□□□ 1.53
SYNE4-201ENST00000324444 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SYNE4-201ENST00000324444 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.58■■□□□ 1.53
SYNE4-201ENST00000324444 AKAP12Q02952 1782 aa24.58■■□□□ 1.53
SYNE4-201ENST00000324444 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.57■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.57■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 RALBP1Q15311 655 aa24.56■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.56■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.55■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.55■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.54■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.54■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.54■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 PSME1Q06323 249 aa24.54■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.52■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 CABP1Q9NZU7 370 aa24.52■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 USP21Q9UK80 565 aa24.52■■□□□ 1.52
SYNE4-201ENST00000324444 A0A1W2PP64 1363 aa24.51■■□□□ 1.51
SYNE4-201ENST00000324444 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SYNE4-201ENST00000324444 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.5■■□□□ 1.51
SYNE4-201ENST00000324444 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.5■■□□□ 1.51
SYNE4-201ENST00000324444 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SYNE4-201ENST00000324444 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SYNE4-201ENST00000324444 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SYNE4-201ENST00000324444 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.48■■□□□ 1.51
SYNE4-201ENST00000324444 SBNO1A3KN83 1393 aa24.48■■□□□ 1.51
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHG5O94827 1062 aa24.46■■□□□ 1.51
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SYNE4-201ENST00000324444 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SYNE4-201ENST00000324444 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.45■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.45■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 NSD2O96028 1365 aa24.45■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.44■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 RGS12O14924 1447 aa24.44■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.44■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGEF10O15013 1369 aa24.44■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 ACEP12821 1306 aa24.43■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.43■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 USP6P35125 1406 aa24.43■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 ATRNO75882 1429 aa24.42■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 SSH2Q76I76 1423 aa24.42■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.41■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.4■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
SYNE4-201ENST00000324444 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SYNE4-201ENST00000324444 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.38■■□□□ 1.49
SYNE4-201ENST00000324444 NLRP13Q86W25 1043 aa24.36■■□□□ 1.49
SYNE4-201ENST00000324444 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SYNE4-201ENST00000324444 SLIT2O94813 1529 aa24.36■■□□□ 1.49
SYNE4-201ENST00000324444 ABCA3Q99758 1704 aa24.36■■□□□ 1.49
SYNE4-201ENST00000324444 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SYNE4-201ENST00000324444 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.35■■□□□ 1.49
SYNE4-201ENST00000324444 ALS2Q96Q42 1657 aa24.34■■□□□ 1.49
SYNE4-201ENST00000324444 USP54Q70EL1 1684 aa24.34■■□□□ 1.49
SYNE4-201ENST00000324444 PIK3C2AO00443 1686 aa24.33■■□□□ 1.49
SYNE4-201ENST00000324444 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SYNE4-201ENST00000324444 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SYNE4-201ENST00000324444 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SYNE4-201ENST00000324444 MRS2Q9HD23 443 aa24.32■■□□□ 1.48
SYNE4-201ENST00000324444 MORC1Q86VD1 984 aa24.31■■□□□ 1.48
SYNE4-201ENST00000324444 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.31■■□□□ 1.48
SYNE4-201ENST00000324444 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.3■■□□□ 1.48
SYNE4-201ENST00000324444 FAM83GA6ND36 823 aa24.28■■□□□ 1.48
SYNE4-201ENST00000324444 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.27■■□□□ 1.48
SYNE4-201ENST00000324444 FYB1O15117 783 aa24.27■■□□□ 1.48
SYNE4-201ENST00000324444 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.26■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.26■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.25■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 PPP2R1AP30153 589 aa24.25■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 GLI3P10071 1580 aa24.25■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 VPS72Q15906 364 aa24.24■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 USP31Q70CQ4 1352 aa24.24■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.23■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 NME9Q86XW9 330 aa24.23■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.23■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.21■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 BTG4Q9NY30 223 aa24.21■■□□□ 1.47
SYNE4-201ENST00000324444 EP400Q96L91 3159 aa24.19■■□□□ 1.46
SYNE4-201ENST00000324444 COG3Q96JB2 828 aa24.19■■□□□ 1.46
SYNE4-201ENST00000324444 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.19■■□□□ 1.46
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