RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323482.8

ACSS1-201, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSS1, Length 3,680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-201ENST00000323482 E9PCH4 1651 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 SPC24Q8NBT2 197 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 DRC7Q8IY82 874 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 GGT6Q6P531 493 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 CASC1Q6TDU7 716 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 RILPL2Q969X0 211 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 NEK4P51957 841 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC27Q2M243 656 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 OFD1O75665 1012 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 ST18O60284 1047 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 ZNF592Q92610 1267 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 NPHP1O15259 732 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.1■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 NECTIN2Q92692 538 aa20.1■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.1■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 USP25Q9UHP3 1055 aa20.1■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.09■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 KIF16BQ96L93 1317 aa20.09■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 CDC45O75419 566 aa20.08■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 ZNF428Q96B54 188 aa20.08■□□□□ 0.81
ACSS1-201ENST00000323482 NUCB2P80303 420 aa20.08■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 KANK1Q14678 1352 aa20.07■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 PTMSP20962 102 aa20.07■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.07■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.07■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.06■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.06■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.05■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.05■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 DCTN1Q14203 1278 aa20.05■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.04■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 WDR63Q8IWG1 891 aa20.04■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 FIBPO43427 364 aa20.04■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.04■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 SMC5Q8IY18 1101 aa20.04■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.03■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 PIK3C2GO75747 1445 aa20.03■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 FBXW7Q969H0 707 aa20.03■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 PREX2Q70Z35 1606 aa20.02■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 NUTM2FA1L443 756 aa20.02■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.02■□□□□ 0.8
ACSS1-201ENST00000323482 PRKAR2BP31323 418 aa20.01■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 ZBTB9Q96C00 473 aa20.01■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 INSRP06213 1382 aa20.01■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.01■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.01■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.01■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 MAP7D2Q96T17 732 aa20■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 TSPY26PQ9H489 355 aa20■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 NUCB1Q02818 461 aa20■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 VGLL3A8MV65 326 aa19.99■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.99■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 SASS6Q6UVJ0 657 aa19.99■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 TMEM63CQ9P1W3 806 aa19.99■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 PLCH2O75038 1416 aa19.99■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.99■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 ATP10AO60312 1499 aa19.99■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.98■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 RABEP1Q15276 862 aa19.98■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 TSPYL6Q8N831 410 aa19.98■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 ERICH4A6NGS2 130 aa19.96■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa19.96■□□□□ 0.79
ACSS1-201ENST00000323482 UNC13BO14795 1591 aa19.95■□□□□ 0.78
ACSS1-201ENST00000323482 BMP2KLQ5H9B9 411 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms