RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 IGHDP01880 384 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 IL16Q14005 1332 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 RGS3P49796 1198 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 ATP7BP35670 1465 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 CABP1Q9NZU7 370 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 TSPOAP1O95153 1857 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 USP35Q9P2H5 1018 aa25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 ZMYM3Q14202 1370 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.08■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 FCHSD2O94868 740 aa25.06■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 RLBP1P12271 317 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 SIRT1Q96EB6 747 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 RIPK4P57078 832 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 NEFMP07197 916 aa25.02■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SPNS1-201ENST00000311008 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 MLECQ14165 292 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 POLKQ9UBT6 870 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 TNNQ9UQP3 1299 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 TECPR2O15040 1411 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF428Q96B54 188 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.95■■□□□ 1.59
SPNS1-201ENST00000311008 KIF16BQ96L93 1317 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 METP08581 1390 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM27P14373 513 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 PRKAR2BP31323 418 aa24.92■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.92■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.92■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 CPS1P31327 1500 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 TNRQ92752 1358 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 NFE2L2Q16236 605 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SPNS1-201ENST00000311008 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.89■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.89■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 COG3Q96JB2 828 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 IL13P35225 146 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 USP19O94966 1318 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.85■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 NME9Q86XW9 330 aa24.85■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 SLC4A3P48751 1232 aa24.83■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 GNAI1P63096 354 aa24.83■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SPNS1-201ENST00000311008 IFT57Q9NWB7 429 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS1-201ENST00000311008 BECN1Q14457 450 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS1-201ENST00000311008 AKAP12Q02952 1782 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS1-201ENST00000311008 FBLN1P23142 703 aa24.81■■□□□ 1.56
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